蛹虫草生物钟节律基因(CmFRQ)的序列分析和表达调控

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蓝光和温度是环境中的重要信号因子,能引起某些真菌的生物节律的变化,而蛹虫草(Cordyceps militaris)中产生和控制生物节律运转的是生物振荡器,其中心成分是frequency(CmFRQ)基因。本论文主要对生物振荡器的中心成分CmFRQ基因进行了克隆、序列分析并研究蓝光和温度对生物钟基因(CmFRQ)表达的影响。在GenBank中以已知的脉胞菌(Neurospora crassa)昼夜节律基因(NcFRQ)mRNA序列进行Blast分析,在蛹虫草全基因组序列中的Cordyceps militarisCM01contiq50序列中发现一段同源序列。通过ORF finder软件分析找到一段可能的蛹虫草CmFRQ-ORF序列。以此为依据设计引物,而后进行PCR、测序和比对,初步证明CmFRQ-ORF就是CmFRQ基因的开放阅读框(ORF),全长为2727bp。再根据CmFRQ-ORF序列和3’ RACE法设计引物,获得了CmFRQ基因的mRNA3’端部分656bp序列,和GenBank中的Cordyceps militaris CM01contig50进行比对,同源性较高。CmFRQ基因可编码903aa,对其进行序列分析表明,其中存在着1个coiled-coil结构域和1个LAM(LAmotif RNA-binding domain)功能域。将CmFRQ-ORF部分序列连接载体pEASY-E1Expression Vector,转化受体BL21(DE3)细胞,菌落PCR鉴定和测序分析表明, CmFRQ基因ORF部分序列原核表达系统基本构建成功。使用实时荧光定量PCR方法研究蓝光和温度对CmFRQ基因相对表达量的影响。结果表明CmFRQ基因的表达在不同蓝光时长对该基因影响不同,相对表达量呈现波浪式变化。在不同温度条件下,基因相对表达量有一定的变化,尤其是在18℃时CmFRQ的相对表达量最高。
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