在卫星导航系统中，由于导航信号的微弱性，接收机很容易受到环境中各种有意、无意干扰的影响，从而导致导航定位灵敏度下降甚至无法定位，所以抗干扰能力是导航系统稳定工作的关键技术之一。本文首先研究了传统的空域和空时联合抗干扰算法，给出了导航系统下的阵列信号处理模型，阐述了自适应波束形成的基本原理和最优准则，在此基础上研究了三种常见的自适应算法。最后通过仿真实验比较了空域和空时联合抗干扰算法在不同干扰环境下的优缺点。针对干扰的带宽特性，研究了针对窄带干扰的自适应陷波器技术，首先给出了三种基本的自适应陷波器，之后对格型IIR陷波器进行了改进，使之能够完全根据输入信号的不同自适应调节陷波器系数。利用改进的陷波器和空域算法，本文提出了一种频域-空域级联的抗干扰算法，先在频域对窄带干扰陷波，然后在空域对宽带干扰及剩余的窄带干扰进行抑制。此方法在保证抗干扰效果的同时尽可能保证导航信号损失最小。最后仿真实验和性能分析验证了算法的正确性和有效性。最后针对某实际硬件项目，搭建了导航抗干扰系统硬件平台，介绍了频域-空域级联算法的具体实现流程。