青藓科(Brachytheciaceae)是侧蒴藓类植物中的大科之一，由于其生态适应性广，为了适应环境青藓科不同种类在形态上常常表现出趋同进化的结果，而不同生长环境中的相同类群却表现出形态上较大变异。因此，从19世纪中叶以来，在青藓科经典分类中，对于某些属、种的的归属问题一直争议不断。本文对内蒙古的青藓科植物标本重新整理、鉴定后，得出目前已知内蒙古地区青藓科植物共12属、42种。通过对该地区青藓科植物从物种组成、区系地理成分、分支分类学、分子系统学等几个方面进行研究得出以下一些结果和结论：　　 1．本区第一大属为青藓属Brachythecium，该属种类占总种数的比例超过50％，同时有7个属只包含单一种，表明内蒙古地区青藓科属的组成比较丰富，但各属的物种组成较为贫乏。　　 2．本区青藓科植物区系成分包括：3个世界广布种，3个旧世界温带分布种，1个热带亚洲分布种，15个北温带分布种，12个东亚分布种，8个中国特有分布种。可以看出该地区的青藓科植物是以北温带成分(占38.46％)为主，其次为东亚成分(占30.77％)，中国特有成分位于第三位(占30.77％)，其它成分(12.81％)仅占较小的比例。　　 3．对内蒙古与其它9个地区进行主成分分析，发现本区与东北、河北这两个相邻地区的区系相似度最高。　　 4．在分支系统树中，鼠尾藓Myuroclada maximowiczii与外类群聚在一起，而分子系统树显示，鼠尾藓与青藓科其它种类聚在一起，说明其在遗传上与青藓科其它种类具有很近的亲缘关系，而形态上与青藓科其它种类差距很大，很可能是因为其在适应环境过程中发生了趋异进化。　　 5．在分支系统树中，毛青藓Tomenthypnumnitens与褶叶藓Palamocladium nilgheriense和同蒴藓Homalothecium sericeum聚在一起，位于树基；而在分子系统树中，毛青藓总是聚在外类群中，说明其与青藓科其它种类间亲缘关系较远。　　 6．分支系统树中，斜蒴藓Camptothecium lutescens与青藓科种类聚在一起，而在分子系统树中斜蒴藓与同蒴藓Homalothecium sericeum以近100％支持率形成姐妹类群，因此认为其与同蒴藓具有更近的亲缘关系。　　 7．分子系统树显示，美喙藓属Eurhynchium与长喙藓属Rhynchostegium、燕尾藓属Bryhnia、毛尖藓属Cirriphyllum以及青藓属Brachythecium的某些类群都分别形成了姐妹类群，说明美喙藓属应该是并系发生的。　　 8．在分支系统树及分子系统树中，石地青藓Brachythecium glareosum与褶叶青藓Brachythecium salebrosum、皱叶青藓Brachythecium kuroishicum与短肋青藓Brachythecium wichurae、卵叶青藓Brachythecium rutabulum与溪边青藓Brachythecium rivulare两两间均形成姐妹群关系，NJ树及MP树自展支持率都超过90％，有的为100％支持，说明它们间比与青藓属其它类群具有更近的亲缘关系。