代办股份转让系统市场扩容大幕行将开启,并有望向个人投资者开放,但却存在诸多市场不规范的现象。笔者认为代办股份转让系统投资者利益保护机制是由投资者参与能力、法律完善程度、公司治理水平、中介机构力量、市场制度、信息披露质量等部分构成的有机联系的系统,文中运用机制设计理论从两个视角来分析代办股份转让系统投资者保护机制的效能。一是根据代办股份转让系统投资者保护机制的基本“构成部分”或“要素变量”,探寻是由于哪几个构成部分的缺陷导致整个机制效能低。二是基于机制三项功能的划分分析究竟是动力不足,传导失效,还是工作不灵导致代办股份转让系统投资者保护机制失效。代办股份转让系统投资者保护机制运行现状表现为动力不足,传导失效、工作不灵三个方面。其中动力不足具体体现为：投资者参与能力不强；监管体系不完善；监管现状混乱,标准不一；单纯的自律监管缺陷；监管主体缺失和手段单一导致约束力不足；法律、法规有待完善；三板投资者查找信息披露和统计交易数据比较困难。其中传导失效,主要是信息披露不合规所致。而工作不灵,具体体现为：市场中介机构发展不够充分,市场机制不健全；流动性不足,交投不活跃；规模极小容易操纵。通过国际三板市场投资者保护的比较及分析,笔者得出我国三板市场投资者保护的经验：1、我国三板市场扩容应有序进行；2、企业进入三板市场挂牌的条件和程序应进一步明确;3、经营和资产质量状况极差、面临破产和能否持续经营风险的三板挂牌公司,对有关风险作及时和定时披露的责任应进一步强化；4、进一步改进三板市场交易方式势在必行;5、交易制度中适时引入做市商机制。笔者认为应从提高监管效率和提升投资者参与能力来优化动力机制,从信息披露制度及公司治理机制的优化来完善传导机制,从加强自律组织建设、引入“做市商制度”和建立惩戒机制及投资者申诉机制来优化工作机制,同时,还应将非正式制度安排纳入代办股份转让系统投资者保护机制设计中。