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宫颈癌发病率和死亡率位居全球女性恶性肿瘤第二位,人乳瘤头病毒持续感染是患宫颈癌的主要原因。早发现早预防是防止宫颈癌的有效手段。因此,研究出一种快速、准确、高通量HPV病毒检测方法尤其重要。本研究以高危型HPV16型和HPV18型的细胞内脱氧核糖核酸、细胞表面脂质为研究对象,建立并优化高危型HPV16型和HPV18型中脱氧核糖核酸及细胞表面脂质的前处理及质谱检测方法,主要研究了利用基质辅助激光解吸电离质谱高通量、快速进行HPV基因分型;原位分析高危型别HPV16型和HPV18型细胞表面脂质差异性。建立HPV基因分型分析方法进行高危型HPV16和HPV18基因分型。设计通用型引物、特异性引物,分别扩增,用FokI和BtsCI酶切,超滤离心管脱盐纯化,进行MALDI-TOF MS检测。HPV16型限制酶切质量多态性质谱峰为2177.4Da,2191.4Da,3692.4Da,3796.4Da,4003.6Da,4006.6Da。HPV18型限制酶切质量多态性质谱峰分布为2177.4Da,2222.4Da,3715.4Da,3740.4Da,3991.6Da,4018.6Da。该方法灵敏度高、高通量、重现性好、特异性强、快速检测,检测成本降低,能精确分型,用于早期筛查。建立一种细胞表面脂质原位分析方法,即HPV16型和HPV18型细胞脂质直接原位基质辅助激光解吸电离质谱分析,区分两种不同的细胞。对大量的原始数据随机森林进行分类,主成分分析降维,能明显区别两种细胞,分类准确率95%。该方法能区分HPV16和HPV18型细胞,用于病毒的初步筛选,操作简单,缺点是不能做到基因分型,特异性不好。把原位分析方法用在植物种子不同部位脂质的分析,以花生和大豆种子为样品,759.18Da、496.37Da、706.85Da、496.37Da分别是花生外种皮、内种皮、胚芽、子叶对应的特征分子离子峰。617.20Da、706.54Da、463.77Da、650.29Da分别是大豆外种皮、内种皮、胚芽、子叶对应的特征分子离子峰。对大量原始数据进行随机森林分类,大豆四分类准确率为100%,花生四分类准确率为92%,因此,该原位分析方法具有普遍适用性。