公益孵化器作为近年来风靡各地的一种社会组织孵化、培育模式,在扶持初创期社会组织发展方面发挥了巨大作用。通过加入公益孵化器接受孵化,初创期社会组织能够获取场地、资金等支持,逐步提升自身能力,更好的运作机构,承接社会服务项目,并能够融入社会组织同行网络,在与同行的交流中对社会组织行业整体有比较深入的了解和把握。但这一模式并非完美无缺,在运作过程中亦面临着诸多困境。困境主要包括资源困境、政策困境、人才困境,具体体现在面临两难选择难以抉择,具体包括:1,在是否要满足初创期社会组织在各个发展阶段的所有需求间难以抉择;2,在是否设立严格的孵化管理制度间难以抉择;3,在是否要采取措施降低孵化器团队离职率间难以抉择;4,在孵化器项目设计优先考虑何方需求间难以抉择。通过研究分析,可以发现这种情况出现的重要原因是孵化器背后存在着多方因素的共同影响。会对孵化器孵化模式设置产生影响的因素包括政府、孵化器运作机构、孵化团队和初创期社会组织,它们之间需求的不一致会使得孵化器项目运作陷入困境,主要表现为:政府需求、机构需求与初创期社会组织需求的不一致可能会使公益孵化器在项目设计及孵化管理制度的设置方面出现困境;机构需求与初创期社会组织需求的不一致会使孵化器服务的具体设置陷入困境;机构与孵化器团队之间需求的不一致亦会使得公益孵化器运作机构就是否应该投入更多的成本以降低孵化器团队的离职率而陷入困境。鉴于此,为了使得公益孵化器能够更好地帮助其服务对象即初创期社会组织成长发展,本文建议孵化器在以下方面采取行动:1,提升孵化器运作机构自造血能力,减少对政府等资方的依赖,;2,建立员工激励及成长机制,完善孵化器团队人员架构;3,提升孵化机构在孵化服务设计中的参与度,建立服务共创制度。