肿瘤细胞核酸适配体自动化筛选仪上位机软件的设计与实现

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国内恶性肿瘤整体防控形势严峻,改善肿瘤患者生活质量和提高其生存率成为癌症诊疗领域的主要目标,而实现这一目标有赖于肿瘤的早期发现和治疗,为此获得有助于肿瘤早期诊疗的特异性标志物是关键。Cell-SELEX(Cell-based Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment)技术可以有效筛选肿瘤细胞特异性分子工具—核酸适配体,并因此发现与核酸适配体结合的肿瘤细胞表面特异性新型标志物。但Cell-SELEX过程本身存在周期长、步骤繁琐以及气溶胶污染等问题,大大限制了肿瘤细胞表面特异性标志物及其检测探针核酸适配体的发现,导致这一技术在肿瘤诊疗领域的应用十分受限。基于此,本课题组研发了一款核酸适配体自动化筛选仪,可以辅助实验人员高效率完成特异性识别肿瘤细胞的核酸适配体的全过程自动化筛选。本文基于该自动化筛选仪,设计并实现了一款用户友好、功能完备、能够实现Cell-SELEX实验流程自定义以及用户数据管理的配套软件系统。本文的主要工作如下:(1)基于自动化筛选仪的功能设计,提出软件需求分析,选定开发方案并最终编码实现。该软件的核心业务是辅助用户通过图形化交互界面完成实验流程设计、自动上传用户实验数据至云数据库;同时在用户需要以及实验条件允许时,通过串口线连接软件和仪器,实现软件对仪器运行状态的控制以及实验进度的跟踪和显示。(2)为了能为用户提供开展实验与数据调研的一站式服务,设计并开发了一款基于Web的核酸适配体数据查询系统,该系统通过C#Web Browser组件提供的浏览器环境内置在软件的数据查询页面中,可满足用户查询、浏览、下载核酸适配体及其关联文献数据的需要。(3)基于黑盒测试理论对开发的软件进行功能测试和实验验证。测试结果表明,本软件运行平稳、交互性强、可靠性高,仪器端能够正确解析软件端设计的实验流程并据此配置实验环境;软件端也能正确接收和解析仪器端发来的实验进展信息并将之实时更新在软件界面上。以上结果表明,本文开发的软件能够配合本课题组研制的核酸适配体自动化筛选仪高效完成核酸适配体的筛选。
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