21世纪以来，各国不断加强自身科技创新能力的培养，伴随着经济全球化的发展，科技成为承担创新的重要责任和使命。高校的科技创新能力是衡量科技发展、社会进步的重要因素，双一流大学具有经费高、科研人员雄厚的重要特点，相对于普通高校具有较大的市场潜力，更能代表中国高校的较高科研水平。在影响双一流大学科技创新能力的诸多因素中，政府科研投入无疑是最具有代表性的因素。
　　本文在内生增长理论模型和知识生产函数模型的基础上，首先明确了双一流大学科技创新能力对于经济发展的推动作用。其次结合文献研究方法，分析国内外政府科研投入与高校科技创新产出间的影响的现状，分别从二者之间影响以及学者如何进行指标选取方面进行阐述。同时，对2010-2017年高校政府科研投入、高校科技创新产出、双一流大学政府科研投入、双一流大学科技创新产出的现状进行描述与分析。此外，详细介绍了门槛回归模型，参考Hansen面板门槛回归模型，选用2010-2017年中国双一流大学数据，从学术价值和经济价值角度，将科技创新产出模型划分为知识型科技创新产出模型与经济型科技创新产出模型，以政府科研投入强度作为门槛变量，在构建的非线性面板门槛模型中分析政府科研投入对双一流大学科技创新产出所具有的“门槛效应”。
　　通过相关研究发现，政府科研投入与双一流大学知识型科技创新产出之间存在显著的双重门槛效应；政府科研投入与双一流大学经济型科技创新产出之间存在显著的单一门槛效应。此外，在政府科研投入强度不断提高的过程中，政府科研投入对双一流大学知识型科技创新产出的影响作用是先由系数较小的正向影响转为相对系数较大的正向影响作用，之后逐渐转变为系数较小的负向影响作用，企事业单位委托资金和研发人员全时当量具有不显著的影响作用。随着政府科研投入强度的加大，对双一流大学经济型科技创新产出的影响作用是呈现不断提升的正向影响作用，企事业单位委托资金和研发人员全时当量具有显著的正向影响作用。之后根据两个模型各自的门槛值划分出门槛区间，将处于最优门槛区间内的高校进行研究与分析，根据门槛回归模型所得出的研究结果，提出具有针对性的建议。