改革开放四十年来,我国一直在为从资源消耗型国家转变为创新集约型国家的目标而努力,企业创新在这一过程中始终处于核心角色。对于每个企业而言,开展创新活动可以增强其核心竞争力,其实现方式便是通过企业创新投入得到相应的创新成果。然而,在不同行业的企业中,创新活动都有着高投入、高风险、长周期等共同的特点,如果创新投入没有产出或是得到的产出无法达到预期的效果,企业都将会遭遇巨额亏损。根据现代风险导向审计理论,注册会计师需要对企业的高风险活动给予足够的关注,创新投入便是其中的一项。基于此,本文从企业异质性假设出发,对企业创新活动如何影响注册会计师审计质量的问题展开研究。本文首先从企业异质性、企业创新和审计质量三者的关系出发,通过文献综述回顾了异质性因素对企业创新的影响、企业创新对审计质量的影响以及企业异质性假设三个方面的相关研究。其次,本文通过对创新理论、一般系统理论、战略管理理论三个方面的阐述,为研究企业创新与审计质量两者之间的关系、以及它们的关系如何被企业异质性因素所影响这两个问题提供了理论基础。再次,本文选取了2012-2016年沪深两市A股737个上市公司作为研究对象,用创新投入的绝对量和年度专利数量来衡量企业创新,采用审计费用和审计报告激进度作为审计质量的替代变量,建立了实证研究模型,检验了企业创新对审计质量的影响,以及企业规模、负债水平、产权性质是否能够促进或者抑制企业创新对审计质量的作用。本文经过实证研究发现:(1)企业创新投入与企业创新产出均与审计质量显著正相关,即企业创新的投入越多,注册会计师的审计质量越高;企业创新产出越多,注册会计师的审计质量也越高。将样本企业按照创新投入分成高投入组和低投入组进行回归后发现,企业创新投入与审计质量的正相关性以及企业创新产出与审计质量的正相关性在高投入组别中更强。(2)通过进一步研究,发现企业规模的大小对企业创新投入和审计质量之间的相关关系具有调节作用,且这种调节作用是正向的,也就是说,企业的规模越大,企业创新投入和审计质量的正相关性越强。(3)企业的负债水平对企业创新投入和审计质量的关系具有调节作用,且这种调节作用也是正向的,即企业创新投入和审计质量的正相关性在负债水平高的企业中表现更强。(4)将样本企业按照产权性质分组后发现,企业的创新投入和审计质量的相关性以及企业创新产出和审计质量的相关性在国有企业组别中有着更强的正向作用。最后,在理论和实证研究结果的基础上,结合当前中国企业创新环境,提出了加强企业自身的创新能力、建设一流创新服务体系、完善与企业创新相关的专项审计制度的建议。