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巴什拜羊具有特殊遗传特征的地方优良品种,具有遗传性稳定、生长发育快、适应性强、耐粗饲、羔羊早熟性强、增膘快、屠宰率高等特点。近年来,对巴什拜羊的研究主要是对生产发育外貌测定及染色体核型分析等方面的研究,对巴什拜羊进行分子水平的研究很少。本文利用微卫星标记对巴什拜羊的遗传多样性及微卫星标记与生产性能的相关分析进行研究,主要为研究巴什拜羊的遗传多样性及培育瘦肉型巴什拜羊提供一些理论依据。本试验利用10个微卫星标记位点对新疆地方优良绵羊品种巴什拜羊4个品系的群体遗传结构和遗传多样性进行分析,通过计算多态信息含量、遗传杂合度、Nei氏遗传距离、系统聚类分析及F-统计量,对4个绵羊品系的遗传结构进行了分析并以5个生长性状(体重、体长、体高、胸围、管围)作为衡量绵羊生长性能的标准,运用最小二乘线性模型,对所检测到的标记基因型与生长指标进行相关性分析,以期微卫星多态性理论对巴什拜羊生长性能进行预测。主要研究结果如下:1.在10个微卫星位点中,共检测到110个等位基因,平均每个座位等位基因数11个,表明所选取的10个微卫星位点在巴什拜羊群体中多态性较丰富。2.4个巴什拜羊群体在不同位点的多态信息含量(PIC)都较高,都在0.5以上,红毛品系、黑毛品系、白毛品系和瘦肉型新品系的平均多态信息含量分别为0.7926、0.7690、0.7721和0.8320,平均杂合度分别为0.8174、0.7985、0.7921和0.8468,说明这4个巴什拜羊群体遗传变异大,遗传多样性丰富。3.4个巴什拜羊群体的总近交系数为-0.1782,群体内近交系数为-0.2112,群体间基因分化系数为0.0237,说明4个巴什拜羊群体间2.37%的遗传变异来自群体间,而97.63%的遗传变异是由各群体内个体间的差异引起的;基因流Nm平均值为8.9167。聚类分析发现,红毛品系与黑毛品系亲缘关系较近,之后与白毛品系相聚,最后与瘦肉型新品系聚在一起,聚类结果与品系育成史基本一致。4.通过微卫星标记与生长性状的相关性分析,并对差异显著的标记不同基因型进行多重比较,结果表明:在BM143位点上,等位基因Ⅰ对体长、胸围、管围、体重有正效应(P<0.05),而等位基因A对体长、胸围、管围、体重有负效应(P<0.05);在BM415位点上,等位基因G对体长有正效应(P<0.05),而基因型DF对体长有负效应(P<0.05);在OARJMP8位点上,等位基因D对体高有一定的负效应(P<0.05);在BL1038位点上,CD基因型度体高、体长、胸围、管围、体重均有正效应(P<0.05);在OARHH35上,基因型CD对黑毛品系体长、胸围、体重具有正效应(P<0.05);基因型BG对红毛品系体长具有正效应(P<0.05),BH对体长具有负效应;在ILSTS018上,基因型AC对红毛品系的体长、胸围、管围、体重有正效应(P<0.05);在BM4311位点上,DG对体长、胸围有正效应(P<0.05),而EJ对体长胸围具有负效应(P<0.05);在BMS648位点上,等位基因F对红毛品系5个生产性状均有正效应,而等位基因D具有负效应(P<0.05)。