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猪α干扰素具有显著的抗病毒作用，真核表达的猪α干扰素生物学活性较高，因此研究真核表达的猪α干扰素对治疗PRRSV具有重要意义。本研究利用实验室保存的猪α干扰素真核表达载体pcDNA3.0-poIFNα转染PK15细胞，制备干扰素，通过细胞水平抗病毒试验检测猪α干扰素体外抗PRRSV活性。PRRSV属于RNA病毒，其基因组容易发生变异，变异分布于整个基因组，其中以GP5基因的变异最大，因此对GP5基因变异的分析在一定程度上可以反映病毒基因组变异的情况。本研究对93株PRRSV分离株GP5基因进行遗传变异和进化，探寻PRRSV流行株进化规律。本试验利用实验室保存的猪α干扰素真核表达载体pcDNA3.0-poIFNα转染PK15细胞，用G418进行筛选并获得稳定表达猪α干扰素的PK15细胞系，收集转染后的PK-15细胞，提取PoIFNα的mRNA，用PCR方法检测到干扰素基因的表达，并用ELISA试剂盒检测猪α干扰素蛋白的表达，根据标准曲线，测得真核表达的猪α干扰素浓度为910.56pg/ml。本试验通过在PRRSV分别感染外周血单核细胞和巨噬细胞前，用不同浓度干扰素处理细胞，利用实验室建立的PRRSV荧光定量PCR方法，检测PRRSV在感染后24h、48h、72h的病毒mRNA水平。结果显示，2到32倍稀释干扰素（28.46-455.28pg/ml）能在感染24-48h抑制病毒在外周血单核细胞和巨噬细胞增殖，但72h后，外周血单核细胞和巨噬细胞上病毒mRNA水平较病毒感染组升高。其中16倍稀释干扰素（56.91pg/ml）预处理的外周血单核细胞，在病毒感染后24h，病毒mRNA拷贝数与对照组相比差异最显著，降低8.8倍；感染后48h，用2、16、64倍稀释干扰素（浓度分别为455.28pg/ml、56.91pg/ml、14.23pg/ml）预处理组，病毒mRNA水平与对照组相比分别降低4.7倍、3.4倍、4.8倍，差异显著。用16倍稀释干扰素预处理的巨噬细胞在感染后24h和48h，病毒mRNA水平最低，分别降低4.64倍、11.01倍，与对照组相比差异最显著。结果表明，16倍稀释的干扰素（56.91pg/ml）抗PRRSV活性最好，干扰素抗病毒活性与病毒感染时间和干扰素的剂量有关，干扰素对PRRSV在外周血单核细胞和巨噬细胞的增殖呈现相似的影响规律。根据2004至2011年60个河南省PRRSV毒株及33个其他省份和地区分离的毒株，分析PRRSV河南分离株的遗传变异情况。序列比对显示，河南PRRSV毒株ORF5序列同源性为87.7%-100%。系统发生分析显示，60个河南PRRSV毒株均属于北美洲型毒株，分属于3个基因亚群，其中，亚群Ⅰ毒株占5%（3/60），亚群Ⅱ毒株占1.7%（1/60），亚群Ⅲ毒株占93.3%（56/60）。基因重组分析显示，亚群Ⅰ中毒株JX0601和亚群Ⅲ中毒株HuB0801基因发生重组，产生亚群Ⅰ中毒株ZJJ07，河南PRRSV毒株在ORF5区域未检测到重组事件发生。选择压力分析显示，河南省PRRSV毒株主要在信号肽区域、胞外区1和N端存在阳性选择，氨基酸变异性较大。密码子偏性分析显示，PRRSV ORF5基因偏好性使用AGA(R)、ACC(T)、AGC(S)、AUU(I)、UUG(L)、AAC(N)、UCC(S)、CCU(P)、GGU(G)、GUC(V)、CCC(P)、UAU(Y)、GUG(V)密码子。这些结果表明，PRRSV在增强病毒感染性、减弱抗体识别及削弱机体免疫应答的关键氨基酸位点存在变异，且多存在阳性选择。疫苗毒和野毒株可能发生基因重组。病毒进化、遗传变异与病毒感染导致的免疫表现有关，如PRRSV感染诱导的细胞免疫和体液免疫能力不强，免疫逃逸等。病毒进化过程中，倾向于增强自身感染力方向的进化，可能是病毒对自身生存的保护行为。