随着政府投入的减少以及公众对于非营利组织提供社会服务要求的增长,企业与非营利组织的合作日益活跃。国内对于跨部门联盟关系的研究虽然也在逐渐兴起,但还远远落后于现实需要,无法发挥理论指导实践的作用。本文在梳理总结既有研究文献的基础上,借鉴企业战略联盟风险管理方法,以经济学中的博弈论视角,按照联盟分类-联盟博弈分析-博弈风险分析-风险控制对策的研究逻辑,对企业与非营利组织跨部门合作联盟的博弈风险进行了分析。根据对外界的依赖程度,将企业与非营利组织的跨部门合作联盟分为封闭式与开放式两种类型,并分析得出：封闭式联盟中的博弈关系是合作博弈、正合博弈；开放式联盟的博弈关系是合作博弈；有限次数博弈与不完全信息博弈普遍存在于两种跨部门合作联盟之中。在此基础上,对不同博弈关系中蕴含的风险进行了研究,认为封闭式联盟会面临固有风险、滥用风险的挑战,开放式联盟会面临外部依赖风险和内部协调风险的挑战,而逆向选择、道德风险及投机行为等风险是两种联盟形式的共有风险。之后从企业、非营利组织以及政府的角度提出了防范博弈风险的措施。关于案例研究,本文选取了企业与非营利组织跨部门合作联盟的典型案例——西安宝马彩票事件进行了分析,该案例与本文的理论分析具有高度一致性,为理论研究提供了实践支持。最后,根据我国跨部门合作联盟发展环境状况,从合作风险源的控制、合作过程风险治理、合作绩效风险控制、外部环境风险防范四个层面提出了跨部门合作风险控制的政策建议、。本文的创新之处在于：①从新的角度对企业与非营利组织结成的跨部门合作联盟进行了分类,并在这个分类的基础上展开了联盟博弈关系及联盟风险的研究；②运用经济学中博弈论的方法研究行政管理的问题,为研究过程的深入和研究结论的得出提供了有力的理论支持,是研究方法运用的新尝试；③专注于跨部门合作联盟风险的研究,分析了联盟伙伴间的博弈对联盟风险的影响,并提出相应对策,对现有的研究体系做了有益补充。