伴随着我国资本市场的不断发展,经济全球化与多样化的不断深入,各大中小企业纷纷紧随市场脚步,不断发展壮大。尤其是近些年来兴起的“新三板”与“创业板”的浪潮,国内中小型企业纷纷把自己包装成高新技术型企业,涌向资本市场,以寻求资金与政策的支持。高新技术企业的发展依赖于新技术、新工艺的研发与利用。不断提高自身的技术创新能力是企业生存的前提,因而研究与开发内部控制在企业的发展中发挥着重要作用。研究与开发内部控制制度设立是否完善,执行是否有效直接影响企业的研发效率,进而影响企业的创新能力。本文首先通过对国内外研究与开发内部控制研究理论的综述,分析研究与开发理论的研究现状;其次对高新技术企业、研究与开发的核心概念进行界定,并详细介绍了高新技术企业发展现状、高新技术企业特点以及研究与开发内部控制理论。文章第三部分,基于以上理论基础,以深圳市KQ股份有限公司为研究样本,以研究与开发内部控制流程为研究主线,详细的分析了KQ公司在研发立项、研发实施、项目验收、研究成果开发与保护上、项目评估的运行情况。文章第四部分指出在此过程中存在的问题,主要表现在:各环节授权审批不严格、制度不完善、管理人员风险意识淡薄等。第五部分针对以上现状和存在的问题,以研发内部控制流程为基础提出相应的优化措施,完善内部控制制度。最后,对本文进行总结,得出研究结论并指出研发过程中的不足,以及对未来的展望。本文提出的KQ公司研究与开发内部控制制度优化的措施,不仅可以完善KQ公司研究与开发内部控制制度,对高新技术企业研究与开发内部控制制度的研究也具有重要意义。