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禽呼肠孤病毒(ARV)是呼肠孤病毒属的成员。ARV广泛存在于鸡、火鸡及其它禽类。由ARV引起鸡的各种疾病逐渐被认识,如:鸡病毒性关节炎、腱鞘炎、鸡的矮小综合症、呼吸道病、肠道疾病、呼吸障碍综合症和骨质疏松等。ARV感染呈越来越普遍的趋势,尤其对肉鸡饲养业,所造成的损失逐年增加。目前,未见关于治疗ARV感染较好的药物和治疗方法报道。siRNA技术作为一种极具吸引力的治疗策略,现已被广泛应用于抗RNA病毒感染的研究中。
RNA干扰(RNA interference,RNAi),又称RNA沉默,是指双链RNA特异性诱导mRNA降解的过程,是一种转录后基因表达沉默(posttranscripitional gene silence,PTGS)现象。近年来RNAi在疾病治疗领域展现出极大的潜力,特别是抗病毒治疗和抗肿瘤方面。
本实验针对禽呼肠孤病毒(ARV)σC基因构建了三个特异性shRNA表达载体(short hairpin RNAs)C1、C2、C3,针对禽呼肠孤病毒(ARV)σNS基因构建了三个特异性shRNA表达载体N1、N2、N3。为评估6个shRNA表达载体的干扰效果,本研究构建了EGFP绿色荧光报告质粒,并建立了Real Time RT-PCR方法定量检测禽呼肠孤病毒σC、σNS和σB基因。
为构建荧光报告质粒pEGFP-σC和pEGFP-σNS,PCR扩增ARVS1733株σC、σNS基因,纯化后将二者分别克隆到pEGFP-N1载体中,构建重组质粒pEGFP-σC和pEGFP-σNS。干扰载体和目的基因报告载体共转染鸡胚成纤维细胞的结果表明,6个干扰载体均在不同程度的干扰了目的基因的表达。
为评估干扰载体shRNA对病毒复制的影响,建立了SYBR Green I荧光定量RT-PCR方法检测禽呼肠孤病毒σC、σNS和σB基因。针对σC、σNS和σB基因分别设计了特异性引物,同时选择了l对扩增内参基因β-actin引物,将PCR扩增的的片段分别连接到pMD18-T载体上构建重组质粒,经筛选、鉴定纯化后,梯度倍比稀释作为标准品,用于实时定量荧光PCR中σC、σNS和σB基因及内参基因β-actin标准曲线的构建。转染shRNA干扰质粒的细胞接种ARV,24h后抽提细胞总RNA,用建立的荧光定量RT-PCR方法检测。结果表明,特异性shRNA可以有效抑制ARV体外增殖。