我国的创业板上市公司自上市以来，逐渐的在上市企业中占据了相当重要的地位。但在创业板快速发展的同时，质疑声也纷纷产生：家族控股普遍化，监管存在漏洞，实际控制人利用职权占有上市公司优良资源，破坏中小股东利益等等。各种治理问题接连出现，严重威胁着创业板及中国资本市场的健康发展。因此需要有针对性的对创业板上市公司股权结构与公司绩效的关系进行研究。本文从以160家创业板上市企业2011年截面数据为研究样本，对创业板上市企业股权结构与绩效之间的关系进行了研究。本文首先分析了创业板上市企业公司的治理特征和股权结构的特点，探寻创业板上市企业公司存在的隐患，然后以内生性的角度研究公司股权结构与公司绩效之间的关系，为促进我国创业板上市企业健康成长提供理论及实证支持。本文主要通过对创业板上市企业公司治理指标的特征分析以及公司的股权结构与绩效的回归分析来进行实证研究，通过研究发现创业板上市企业普遍存在股权集中度较高、国家股比率与流通股比率较少等特点进行回归分析。回归分析的主要结论：（1）企业绩效与股权集中度之间存在正相关关系但不显著。（2）企业绩效与国家股比例无显著相关关系。（3）企业绩效与法人股比例显著正相关。（4）企业绩效与流通股比例无显著相关关系。(5)企业绩效与公司高管层持股比例呈正相关但并不显著。以实证研究的结果为依据，为优化创业板上市公司治理结构，提高绩效，本文提出以下几点建议（1）合理利用指标对公司绩效排名进行分析（2）增强持股股东与管理层长久持股理念，避免以短期资本获利为目的的一上市即减持现象。（3）大力发展股权激励机制，增强公司管理层与持股股东的监管与约束。（4）合理促进法人股比例提升，借鉴国外治理模式探索新的出路。