农业直接关系国计民生，发展农业是经济工作的重中之重。近年来，国家对农业越来越重视，为鼓励和扶持我国农业发展，国家出台了一系列税收优惠政策和照顾性措施。虽然已有的一些税收优惠措施对农产品收购企业的发展起到了积极作用，但是，相关政策的不尽完善，造成国家税收流失的同时，反而变相的增加了农产品收购企业的税收遵从成本，进而导致纳税人税外负担的加重，最终不利于农产品收购企业追求自身利益最大化目标的实现。因此，降低农产品收购企业的税收遵从成本是实现农产品企业良性发展的重要内容。但目前针对税收遵从成本的研究还涉及不深，本文从农产品收购企业视角出发，深入研究和探讨其税收遵从成本，具有一定的现实意义。本文以农产品收购企业的税收遵从成本为研究对象，以博弈论、信息不对称理论、激励理论和公平理论为基础，采用规范研究方法分析了农产品收购企业的税收遵从成本。本文选择从时间成本、货币成本和心理成本的角度对其现状进行分析，作出了基本判断，认为农产品收购企业的税收遵从成本相对较高。进而在基本判断的基础上提出不合理的税制设计、税务稽查、企业内部控制制度不完善等因素是导致农产品收购企业税收遵从成本较高的主要原因。基于此，本文提出了完善现行税收制度，优化纳税服务措施，加强农产品收购企业内部控制，提高农产品收购企业纳税申报效率等政策建议，以便降低农产品收购企业的税收遵从成本。