【摘 要】
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背景:阿尔茨海默症(Alzheimer’s disease,AD)是一种起病隐匿、进行性发展的神经退行性疾病,主要是发生于老年人群,且随着年龄的增长患病率显著升高。患者主要表现为学习记忆等认知功能降低。在利用AD小鼠模型开发治疗AD相关的靶向药物时,往往出现在应用于小鼠的药物时,对应用于人的AD的治疗往往不那么显著,甚至起到完全相反的作用。目的:通过单细胞转录组学的方法分析人和小鼠在AD和正常组之
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背景:阿尔茨海默症(Alzheimer’s disease,AD)是一种起病隐匿、进行性发展的神经退行性疾病,主要是发生于老年人群,且随着年龄的增长患病率显著升高。患者主要表现为学习记忆等认知功能降低。在利用AD小鼠模型开发治疗AD相关的靶向药物时,往往出现在应用于小鼠的药物时,对应用于人的AD的治疗往往不那么显著,甚至起到完全相反的作用。目的:通过单细胞转录组学的方法分析人和小鼠在AD和正常组之间的差异,以及其中的细胞类型的组间差异,再通过比较人和小鼠的同一细胞类型之间的差异基因的特点,得到人和小鼠模型之间的异同点,为后续的药物开发以及靶向治疗提供参考。方法:1)单细胞核测序的数据:用基因表达数据库(gene expression omnibus https://ww w.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi),样本的数据集为GSE157827数据集,样本是人脑的前额叶皮层脑区,包含六个样本,三个样本的(GSM4775661GSM4775663)的阿尔茨海默症患者样本,三个样本的正常样本。鼠的样本的数据集为GSE143758,样本是小鼠脑的前额叶皮层脑区,包含四个样本,其中7月龄小鼠的5x FAD和野生型C57BL/6各一只,10月龄小鼠的5x FAD和野生型C57BL/6各一只.。2)对人和小鼠的数据分别进行质控、整合。3)在相关文献以及Cell Marker网站中鉴定人和小鼠数据集中的细胞类型。4)分别在人和小鼠的数据集中,对鉴定出来的细胞类型在AD和正常组之间求差异基因5)对这些差异基因通过阈值的筛选区分出上下调基因,分别进行通路分析。6)对人和小鼠的基因进行同源基因转换。7)将人和小鼠数据集的分析结果进行对比。结果在人类星型胶质细胞中高表达BSG、CST3、CLU、GJA1、APOE、MLC1、CD81、FTH1、PTN。Cst3基因分别在七月龄小鼠的星型胶质细胞和少突胶质细胞中上调,在十月龄小鼠中表达不显著。Clu、Gja1基因在七月龄和十月龄小鼠的星型胶质中表达水平均为上调。在人类少突胶质细胞中,人类AD样本高表达APOD、ACTB、CD81、FTH1基因,其中Apod、Fth1基因在10月龄小鼠的少突胶质细胞中高表达,Actb在十月龄小鼠的星型胶质细胞中高表达。结论本研究通过对小鼠和脑组织前额叶和人类脑组织前额叶组织的单细胞转录组学学分析表明,人类AD细胞反应和Aβ积累的5x FAD小鼠模型显著不一致。
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