本文研究了长白山、汤旺河、黑河胜山和海参崴四个地区的天然红松种群在形态、解剖特征和遗传等不同层次的变异和适应机制；首次建立了红松ISSR-PCR反应体系；通过ISSR分析了不同种群的遗传结构、种群间的遗传分化；探讨了红松对海拔因子的适应机制；比较了粗皮与细皮红松之间的遗传结构。 1．对不同种群间的针叶长、一年生枝长和种子千粒重的研究中发现，一年生枝长度和千粒重在三个种群中差异不显著，针叶长在三个种群中有较明显的差异，平均值随纬度增高而减小，随着海拔升高，低等级针长(6—9cm)的百分率升高，高等级针长(11-16cm)的百分率降低。 2．首次建立了红松最优ISSR-PCR的体系。 3．15个引物对全部87个体扩增的多态位点的比率为60.7％，平均每个引物3.6个多态位点。四个种群的遗传多样性水平为：汤旺河＞长白山＞黑河胜山＞海参崴，红松分布的中心区的遗传多样性要大于边缘区。 4．红松种群内的基因多样性占总的基因多样性的72.99％，种群间基因多样性占总的基因多样性的27％，说明红松的变异主要来自种群内部。 5．红松呈现随海拔升高，遗传多样性降低的趋势。不同海拔红松之间的遗传距离和地理距离之间有明显的正相关性，而且不同海拔之间的遗传一致度较大，海拔因子对红松的隔离较小。 6．对不同地区粗皮与细皮红松ISSR的分析表明，两者在遗传上可能并无明显差异，树皮在形态上的差异纯粹是环境饰变的结果，或者两者的差异序列不在SSR引物的结合部位。 7．红松的遗传多样性水平在松科植物中是比较高的，而且红松种群间的遗传分化较为明显，说明红松分布区逐渐缩小的原因是由于人类的破坏作用，再加上火灾和风倒等因素造成的。 以上研究为红松的良种选育和保护策略的制定提供了理论依据。