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第一部分:肠道菌群模式与早产儿坏死性小肠结肠炎和迟发型脓毒血症研究目的探究早产儿坏死性小肠结肠炎(NEC)和迟发型脓毒血症(LOS)的发生发展与早产儿出生后肠道菌群定植模式的相关性。方法入组24名早产新生儿,其中4名在住院后发展为NEC,3名为LOS,其余17名为无肠道感染对照组。从出生后的第一天开始收集粪便标本,纵向收集直至患儿出院,共收集192个粪便样本。扩增每个粪便样品的16s r RNA基因的细菌V3 V4区域并测序;后续分析包括:OTU聚类,各分类水平注释,多样性分析和多级物种判别分析。结果从出生后第14天开始,肠道微生物群定植模式开始在NEC,LOS及其匹配的对照组之间出现差异。迟发型脓毒症早产儿的肠道微生物群多样性最低(Shannon指数=1.66),对照组保持最多样化(Shannon指数=0.88,p=0.01)。潜在致病菌属肠球菌(20.86%)、葡萄球菌(8.67%)和链球菌(8.58%)的相对丰度在NEC患者中最高(p=0.034),而在LOS组中为克雷伯氏菌(42.15%,p=0.023)。对照组较NEC和LOS组含有更多的乳球菌(分别为13.76%,7.98%和3.66%,p=0.028)结论肠道菌群定植失调与早产儿NEC和LOS发生和发展相关,尤其是潜在致病菌属,包括链球菌、葡萄球菌和克雷伯菌的相对丰度增加与上述疾病发展相关。第二部分:儿科肠道炎症性疾病与肠道菌群研究目的比较先天性巨结肠(HD)、先天性巨结肠小肠结肠炎(HAEC)、坏死型小肠结肠炎(NEC)和炎症性肠病(IBD)肠道菌群的异同。方法入选HAEC患儿4例,HD患儿7例,NEC患儿6例,IBD患儿7例,共24例。采集其横向粪便标本,共58个,其中HAEC标本14个,HD标本22个,NEC标本15个,IBD标本7个。扩增每个粪便样品的16s r RNA基因的细菌V3 V4区域并测序;后续分析包括:OTU聚类,各分类水平注释,多样性分析和多级物种判别分析。结果三组肠道感染患儿,包括HAEC、NEC和IBD的肠道菌群α多样性相仿,且均低于巨结肠患儿;另外,菌群内部组成和丰度(β多样性)在四组患儿间未见显著性差异(PC1=32.07%,PC2=24.84%)。从分类进化角度,肠炎患儿菌群在门水平上的组成大致类似;但具体到属水平则各不相同:HAEC患儿以肠球菌为优势菌属(38.02%,p=0.01),总体组成成分与HD类似;IBD患儿各菌属丰度大致相当;NEC患儿肠道菌群构成则较为简单,且以克雷博菌属为主导菌。另外,IBD组可见较高水平的韦荣氏球菌(14%,p=0.02),后者与肠道黏膜上皮炎症反映密切相关。结论肠道微生态失衡包括多样性降低、格兰阴性菌丰度增加,其对于肠道炎症状态的影响具有一定共性,这也可能是三种肠炎有着类似临床表现和病理特征的内在关联因素。