因果理论是佛教整个理论体系的基础和根基，整个佛法所讲的都不出因果”两字。果由因缘和合而生，有什么样的因就会感什么样的果。因者，即亲生是因，而疏助为缘，因的作用是能生，缘的作用是长养。有而无缘，诸法不生；有缘而无因，诸法亦不生。因此，一切法都不是独生起来的，而是由于因缘和合而生。《阿毗达磨俱舍论》全论都没有离开因果，其立论宗旨是要人们彻观谛因果，并且彻悟因果之理，降伏烦恼，从而最后达到涅槃。诸法都是在业力的作用下才感生果的，六因是感生果的亲因，是直接因，而四缘是疏缘，是外在的条件。因缘和合，果方生起。自无始以来，世间的一切有情众生都处在生死流转的因果链条之中。树菩萨在《大智度论》中说“诸法因缘生，是法说因缘。是法因缘尽，师如是言”。上至圣者还灭因果，下至有情众生流转因果，都没有出因果，法因缘和合而生，诸法因缘和合而灭。在无常中生死流转的一切有情众生都是苦的，而这世间中的种种差别、所有的苦果都有因缘，即由业所感生，业又由烦恼而引起。业是世间苦果的亲因，烦恼是疏缘，因缘和合而生世间。世间的一切有情众生都以惑、业、苦三者的因果流转为形式在五趣之中生死轮回，惑、业、苦三者的流转以十二因缘的因果关系来展开，以三世两重因果为形式来实现其业报轮回。此为流转门。由于无明是一切烦恼的根本，是一切苦的根源。因此，只有彻底地降伏无明，其余的十一支缘起法才会一起降伏掉；只有彻底地降伏无明，才能脱离五趣的生死轮回，并最终证涅槃。只有修行戒、定、慧三无漏学，具足戒行、定力和智慧，才能降伏一切烦恼并最终证涅槃。持戒、禅定和智慧对治的是有情众生的贪、瞋、痴三毒。戒行能够降伏贪爱之心，止息烦恼，从而防止恶行的发生；禅定能够降伏瞋恚之心，息虑静缘，止息妄念，不攀缘外境，从而使心安住；智慧能够降伏愚痴，破除迷惑，证得真谛。只有勤修三无漏学，发起无漏慧，才能降伏一切烦恼，脱离生死轮回，由凡入圣，并最终证涅槃。此为还灭门。