经历显生宙以来最大的灭绝事件之后的早三叠世是地球发展历史上的一个特殊时期。因此,早三叠世的地质学研究已成为当前国际地学新的热点。下三叠统中发育多套微生物岩沉积,被认为是探索大灭绝成因以及灭绝后环境变化的重要载体。同时微生物岩作为良好的油气储层有着得天独厚的优势。本文以川东地区飞仙关组三套典型的微生物岩为研究对象,开展岩石学、地球化学以及储层地质学的相关研究,并得出以下结论:（1）川东地区飞仙关组发育三套典型的微生物碳酸盐岩,分别发育于格里斯巴赫亚期早期、格里瑟巴赫亚期中期以及丁纳尔亚期中期。其中第一套与第三套见于普光钻井岩心,分别位于飞一段底部与飞三段,主要类型为凝块石;第二套见于北碚白庙子剖面飞一段顶部,为典型的叠层石生物丘。（2）区内微生物岩格架是由囊状微生物群落或石内蓝细菌钙化搭建而成,并发育于浅潮下与深潮下之间的沉积环境之中。结合全球海水性质以及环境背景,认为微生物岩的发育主要受控于古海水温度与缺氧环境导致的后生动物减少。（3）普光地区微生物岩储集岩主要为网状凝块石、层状凝块石、叠层石以及颗粒粘结岩,其中凝块石的物性参数最好。微生物岩储层以中孔-低中渗为主,局部存在高孔高渗,整体为孔隙型储层。储层主要受到沉积作用、溶蚀作用、白云石化作用以及构造作用所控制。其中微生物岩的特殊的结构特征为储层的形成提供了良好的物质基础,早期大气淡水溶蚀作用则是储层形成的根本原因,白云石化作用为储层提供了更抗压溶压实的岩石骨架,构造作用形成裂缝沟通各个储渗体,最终推动储层形成。