【摘 要】
:
自动精确分割病理图像中的细胞核在癌症诊断中起着重要作用。针对病理图像中细胞核大小差异较大从而导致细胞核分割结果不准确的问题,本文提出了一种基于Mask R-CNN的大小自适应细胞核自动分割新方法。该方法分三步,首先对病理图像进行预分割,然后通过预分割的结果把该病理图像分到预先设定好的某一类,最后使用对应类的训练好的模型对病理图像再次分割,得到最终的细胞核分割结果。其中,对应类的模型是使用分类后的训
论文部分内容阅读
自动精确分割病理图像中的细胞核在癌症诊断中起着重要作用。针对病理图像中细胞核大小差异较大从而导致细胞核分割结果不准确的问题,本文提出了一种基于Mask R-CNN的大小自适应细胞核自动分割新方法。该方法分三步,首先对病理图像进行预分割,然后通过预分割的结果把该病理图像分到预先设定好的某一类,最后使用对应类的训练好的模型对病理图像再次分割,得到最终的细胞核分割结果。其中,对应类的模型是使用分类后的训练集图像训练得到。分类是基于聚类的方法,其依据是图像中细胞核的平均大小。实验数据来源于2018 Data Science Bowl(2018 DSB)挑战数据集,该数据集包含一个训练数据集和两个测试数据集。通过与Mask R-CNN、U-Net以及最新细胞核分割方法比较,实验结果证明,该方法都优于这些方法,其DSB-Score的值分别为0.471和0.580,F1-Score的平均值分别为0.780和0.864。该结果虽然比基于DSB挑战数据集所提出的方法的最好结果差,但本文提出的方法更易于实现,且其训练所需的数据仅来源于DSB训练数据集。为了验证提出方法在新数据集上的有效性,还与Mask R-CNN在Nuclei Counting100数据集上的人工计数结果比较,实验结果表明该方法优于Mask R-CNN,其差值平均数为108。尽管前一项研究的结果取得不错的效果,但是对于具有重叠的细胞核,且重叠区域较大的细胞核的分割效果较差。针对该问题,本文首先提出了基于细胞核中心区域和轮廓感知的多任务模型,但该模型计数结果不理想。因此为了改进上述方法,提出了基于分类的细胞核的计数新方法。该方法是在细胞核分类分割的基础上再次训练新的细胞核中心区域检测模型。本文首先使用欧式距离转换的方式对分割结果进行距离转换,然后使用对应类的中心区域检测模型进行检测,得到该距离转换图中的中心区域,从而实现对重叠细胞核的计数。训练模型时用到的细胞核中心区域,是通过固定阈值在训练图像的距离转换图中获取。跟本文在前一个研究中提出的方法、Mask R-CNN方法和最新的方法在2018 DSB数据集上比较,实验结果显示本文提出的方法获得的计数结果,与真实结果之间的差值平均数最小,分别是15.26和6.99。该方法与Mask R-CNN及前一个研究中提出的方法在Nuclei Counting100数据集上比较的结果表明,该方法的差值平均数为119.22,优于Mask R-CNN,但低于前一个研究的方法。该方法的R平方值为0.6499,与前一个研究中的方法相近,但要明显优于Mask R-CNN。本文的两个研究内容所提出的方法,在细胞核分割和计数上都有较好的结果,尤其是对于细胞核大小分布差异较大的图像。同时,该方法对于检测大小差异较大的目标的检测,或者形态差异较大的目标的检测具有较好的借鉴意义。
其他文献
城市化进程的不断加快,使得城市用地越来越紧张,且随着大量工业化建筑的急剧增加,生态系统被破坏,环境恶化,能源短缺,城市公共空间缺失等问题随之出现,人类面临着严峻的生存危机。在此背景下,人们把追求生态环境效益作为城市设计的主要目标,巧妙的利用和顺应自然环境、与大自然密切联系着的覆土建筑逐渐成为推动生态建设的一股中坚力量。覆土建筑从古代的穴居到近代的窑洞,再到当代的公共建筑,其适用范围越来越大。因此,
通过分析唇部动态识别出说话者的表达内容是唇语识别的基本目的,其在人机交互领域是广受关注的研究项目。由于传统唇语识别模型具有速度慢,训练难度大的特点,在基于不同场景的唇语识别技术上需要大量的人工设计与经验性处理。所以本文选择基于深度学习建立唇语识别模型,但是在资源紧凑的设备上,大部分性能优异的卷积神经网络都无法展示自己的高效识别能力。因此,卷积神经网络的压缩与加速成为众多学者的热门研究课题,经过网络
水下鱼类识别在合理开发渔业资源,维持生态平衡等方面有大量的应用需求,开展水下鱼类识别的研究具有广阔前景。然而受限于鱼类数据集规模通常较小、鱼类特征复杂等因素,使用既有鱼类识别方法获得的结果往往存在识别精度不高、检测速度慢的问题。为解决上述鱼类识别挑战,本文对比分析了目标检测算法的网络架构,基于深度学习技术设计了两种方法,并通过对比实验验证了模型的有效性。本文的主要研究内容如下:针对如何提升水下鱼类
随着近年来伺服技术的不断改进,多轴同步系统的应用越来越广,充分考虑刚度、阻尼和质量等影响机械系统动态性能的因素,建立一个高精度的电火花龙门式机床多轴同步系统,对电火花机床等数控设备的开发与生产具有重要意义。面对目前多轴同步控制存在的同步性能差,易因外界扰动失去其稳定性等缺陷,本文针对电火花加工龙门式机床,根据其电加工摇动、平动以及Z轴多次往复的加工特点,对机床的X、Y、Z轴均采用双轴同步控制,通过
随着深度学习及人工智能的发展,唇语识别技术在计算机视觉及人机交互领域有着深厚的发展前景与应用需求。尤其是在利用自动唇部识别技术来改善听力障碍者和发音障碍者的社交互动方面,更是人工智能在医疗保健和康复中最有前途的应用之一。所谓唇语识别技术就是通过嘴唇视觉图像的动态变化来识别主要人物表达的内容。当前阶段,唇语识别技术主要停留在对算法以及计算机性能的研究上,很少将其真正的运用到实际生活场景中。因此,本研
地震勘探作为最有效的油气勘探方法之一,一般包括地震资料采集、地震资料处理、地震资料解释三个阶段。在实际采集工作中,存在由于地表起伏和低降速带的变化而造成的信号干扰,为此,首先需要对地震资料进行静校正。初至拾取是得到合理静校正结果的先决条件,它为静校正过程提供了进行后续计算所需的静校正量。现有初至拾取方法主要分为自动化和半自动化方法。一般而言,对于数据单一、噪声干扰小的资料,现有自动方法多数可以快速
人脸验证技术是近年来计算机视觉最为热门的研究方向,其被广泛应用于各种身份验证场景。目前对于人脸验证的研究已经发展到了较为成熟的阶段,现有算法在LFW人脸验证数据集上已经达到了99%的准确率。数据是深度学习算法的核心,取得这样优秀成绩的算法大部分都是基于上百万的人脸数据的前提下训练的。然而在实际应用中,并不是所有的场景都能够获取到大量的脸人图片训练样本的,例如人证比对和人脸亲属关系验证都是目前人脸验
尽管计算机断层扫描(Computed Tomography,CT)给医生诊断带来了所见即所得的支持,但是其高剂量可能带来的健康危害一直受到研究者高度关注。为此,使用低剂量来进行断层成像成为首选的解决办法。然而,放射剂量的降低往往会导致大量噪声的引入,进而影响医生的诊断。因而,如何在降低辐射剂量的同时有效地提高图像质量成为当前CT重建技术研究的重要挑战。一般CT重建涉及到两个域:投影域(Sinogr
近年来,工业机器人在工业生产中的应用越来越多,因此对工业机器人相关人才的需求呈爆炸式增长,导致了工业机器人领域的高端技能型人才变得供不应求,人才培养面临严峻挑战。本文基于Unity3D虚拟现实引擎和Qt5开发平台,结合职业教育相关理念,开发出一款基于示教器的工业机器人运动控制仿真系统,从使用者角度出发,实现其操作示教器以控制虚拟环境中机器人实时运动的体验真实感。首先,对ABB工业机器人进行运动学轨
可见光图像符合人眼视觉特性,而红外图像能够体现场景温度信息,二者的成像谱段和原理不同,但都具有重要应用价值。传统建模的红外图像仿真方法精度较低且建模复杂,而可见光的图像资源丰富,因此本文研究一种从可见光图像直接转换至红外仿真图像的方法,具有高效率、低成本、高精度的特点。本文的主要工作如下:(1)提出一种两级轻量多尺度信息融合生成对抗网络,采用“由粗到细”的两级网络结构,能够实现可见光与红外图像的特