本研究以三峡库区典型支流小江流域鲢、鳙鱼控藻示范区为研究对象。通过长期、定点的野外监测,对小江流域水质、水环境进行采样分析。重点分析了小江流域水体理化因子、浮游植物、水体重金属等指标的时空分布特征及变化规律。并对该流域常见经济鱼类进行解剖采样。鱼体内各组织器官重金属元素含量进行检测。主要取得以下结论:(1)流域水体理化因子在垂向上差异不明显,表底分层不显著,水体掺混完全。主要原因是小江作为三峡库区最大的消落带区,受干流回水影响,通过水体交换作用水体垂向掺混。全流域6个样点监测结果显示,小江水体各检测样点总氮含量都很高,均已超出1.0mg/L,远超过富营养化体总氮阈值(0.2mg/L),根据《地表水环境质量标准》(GB 3838-2002),已达到Ⅴ、Ⅵ类水体。(2)三峡库区典型支流小江流域的浮游植物种类组成以绿藻、硅藻、蓝藻为主,在定量分析中显示出硅藻、蓝藻占多数(一半以上),说明小江浮游植物全年四季度均表现为湖泊型类群。浮游植物细胞密度取值范围为88.8×10~5～724.4×10~5cells/L,最高值与最低值差异显著,说明小江浮游植物密度随季节变化而显著变化。因此,不同季节水华暴发风险存在一定差异,在浮游植物峰值出现的夏、秋季节水华暴发潜在风险增大,需要引起关注。(3)重金属Cr、As、Cd、Cu、Pb均呈现出较强的分层现象,重金属浓度表层>中层>底层,且起伏趋势随深度增大趋于平稳。仅在重金属含量峰值最大的表层水样中,6月份黄石断面Pb浓度范围为15.77μg/L,达到Ⅲ类水标准,其余样点重金属浓度均符合Ⅰ、Ⅱ类水标准。所有被监测重金属含量均未超出《生活饮用水卫生标准》(GB5749-2006)。(4)三峡库区典型支流小江流域常见经济鱼类的肌肉重金属含量无明显健康风险,食用安全性高。但肌肉组织外其他组织器官的重金属含量存在一定的健康风险。