胃癌组织miRNAs的异常表达及其临床意义

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第一部分肠型胃癌miRNA表达谱目的:筛选肠型胃癌组织异常表达的miRNAs.方法:我们采用miRCURYTM Array LNA microRNA chip基因芯片比较肠型胃癌组织和邻近非肿瘤组织之间差异表达的:niRNA,6对配对的病理标本均属于肠型胃癌的TNM分期的Ⅲ期或Ⅳ期。设定平均上升或下降倍数大于2倍和p值小于0.01为标准。结果:发现在40个上调基因表达的miRNAs中,其中24个基因已证实在胃癌癌组织中异常表达,新发现异常表达的miRNAs也包括一些最新鉴定的基因如miR-886-5p、miR-1259和miR-1308等。在36个下调基因表达的miRNAs中,19个miRNAs已报道在胃癌组织中异常表达,在肠型胃癌组织中新发现了17个miRNAs异常表达以及未知功能的miRNAs等。RT-qPCR结果显示,5个表达上调的miRNAs在29例肠型胃癌肿瘤组织中也异常高表达,;同样5个表达下调的miRNAs在肿瘤组织中也呈低表达。对基因芯片与RT-qPCR分析结果进行Pearson相关性分析,发现表达上调的miRNAs其R值为0.98,表达下调miRNA其R值为0.90,所有10个表达异常niRNAs其R值为0.96。Clustering聚类分析显示所有76个miRNAs表达模式非常相似,相同的病理分期标本归于同一亚簇。相对于以往的研究,我们在肠型胃癌基因芯片分析中鉴定了更多的miRNAs,也发现许多新的miRNAs在在肠型胃癌中异常表达。结论:①首次报道肠型胃癌组织miRNA表达谱。②筛选了在肠型胃癌组织中76个异常表达的miRNAs,其中43个miRNAs已报道在胃癌或胃癌细胞系中呈异常表达,33个为新发现在肠型胃癌组织中异常表达的miRNAs。③RT-qPCR扩增分析确定了本研究miRNAs基因芯片分析的可靠性。第二部分肠型胃癌与弥漫型胃癌组织miRNA表达差异的研究目的:肠型胃癌与弥漫型胃癌存在不同癌变分子机理,分析miRNA表达模式与表达水平在肠型胃癌与弥漫型胃癌组织中是否存在差异。方法:选择4个在胃癌组织中异常表达的miRNAs,采用RT-qPCR检测21例配对的弥漫型胃癌组织及癌旁组织与29例配对的肠型胃癌组织及癌旁组织miRNAs的表达水平。结果:①与配对的癌旁组织比较,miR-27a在弥漫型胃癌组织中增加至癌旁组织的5.54倍,在肠型胃癌组织中的表达水平增加至癌旁组织的3.22倍,虽然两者均呈现高表达,但在弥漫型胃癌组织中miR-27a表达更高,与肠型胃癌相比,具有显著性差异。②miR-494在肠型胃癌组织与弥漫型胃癌组织中均表达下调,相对癌旁组织,弥漫型胃癌组织中下降至癌旁组织的0.23倍,而在肠型胃癌组织中只下降至癌旁组织的0.43倍,且两者之间存在统计学差异。③与配对的癌旁组织比较,miR-145在肠型胃癌组织中下调至癌旁组织的0.34倍,有显著性差异:但在弥漫型胃癌组织中miR-145表达水平与癌旁组织比无显著性差异。④miR-886-5p在两种亚型胃癌组织中均表达上调,在两种亚型胃癌组织中表达水平相似,统计学分析两者无显著性差异。结论:miRNAs在两个亚型癌组织中呈现不同的表达模式与表达水平,这可能与两种亚型癌不同的病理进程相关。阐明不同亚型间miRNAs异常表达模型与表达水平的差异,将有助于阐明胃癌癌变的分子机理。第三部分miRNA的表达水平与肠型胃癌的病理分期相关目的:确定miRNAs的异常表达是否与肠型胃癌的恶性演进相关。方法:选取了4个可能与肿瘤转移相关的miRNAs,采用RT-qPCR分析其在29例不同病理阶段的肠型胃癌组织表达水平的变化。结果:①与癌旁组织比较,niR-32在肠型胃癌Ⅰ期病理标本中表达水平明显上升,但其表达水平比Ⅲ与Ⅳ期病理标本相比明显降低,p值分别是0.0046和0.004。虽然Ⅱ期和Ⅲ期病理标本之间miR-32表达水平没有明显差异,但Ⅳ期与Ⅱ期病理标本之间存在显著性地差异。②与癌旁组织比较,miR-182在肠型胃癌各期标本中均表达上调,但在Ⅰ期病理标本与Ⅱ期病理标本之间、在Ⅲ期与Ⅳ期病理标本之间无显著性差异,但Ⅰ期&Ⅱ期与Ⅲ期&Ⅳ期病理标本之间,具有显著性差异。③与癌旁组织比较,miR-143在Ⅳ期病理标本中显著表达下调,与Ⅰ期&Ⅱ期相比,有明显差异,p值分别为0.032和0.035。④miR-886-5p在各期肠型胃癌组织中表达下调,但Ⅰ期与Ⅲ期、Ⅰ期与Ⅳ期病理标本之间无统计学差异。结论:niR-32、miR-182和miR-143表达水平的差异与肠型胃癌的病理分期相关,它们可能参与了肠型胃癌恶性演进过程。总之,本研究筛选了一批新的miRNAs在肠型胃癌组织中异常表达,分析了一些miRNAs在肠型胃癌与弥漫型胃癌中表达模式的差异,同时,发现了miR-32、miR-182和miR-143异常表达水平与肠型胃癌病理分期相关,这些研究将为阐明肠型胃癌癌变的分子机制提供新的线索,为胃癌的早期诊断、判定预后提供可能的分子标志物及干预靶分子,具有潜在的临床应用价值。
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