实行项目法人责任制是历史经验的积累，是建设管理体制改革的核心内容，是国家的政策要求。本文通过对项目法人责任制内涵、运作的阐述，分析在经营性项目实施中的意义。在对公益性水利工程财务特征、经济学特征、项目管理特征充分分析的基础上，对公益性水利建设项目法人责任制相关问题进行研究，分析项目法人的主体特征，明确责任主体和政府的职责定位，并对运行作模式进行了深入的探索，最后以临淮岗洪水控制工程为例，对项目法人责任制相关问题进行实证研究。 本文在分析研究现行公益性项目法人责任制存在问题的基础上，就责任主体的明确、项目法人的主体特征、政府在公益性水利建设项目中职责定位、运行模式的探索、流域机构在实行公益性项目法人责任制的地位以及公益性水利工程实施项目法人制的外部环境等方面进行了全面的论述。从公益性水利工程的特点看，明确阶段性责任主体在实际中是可行的。在公益性水利工程项目建设管理中，政府职责应定位在：审批项目和项目筹资、组建项目法人、监督项目法人、项目竣工验收及后评估、协调项目外部环境、建立规范的市场秩序，大力培育设计、监理、施工、咨询、工程管理公司等市场主体和规范这些市场主体有关的法律法规的制订。对国民经济和社会发展有重大影响的以公益性为主的流域控制性工程，流域机构作为投资主体和建设主体的建设管理模式正在逐步形成。流域机构作为投资主体与建设主体，建立起规划、设计、建设、管理、经营全过程的管理模式，实现资源优化配置，逐步形成以流域机构为主体和单元的流域滚动开发机制。