在荒漠地区的固定、半固定沙地和流动沙地上，微生物、藻类植物及地表、苔藓植物可凝聚土壤颗粒形成生物土壤结皮(BSCs)，其在荒漠化土壤植被恢复具有举足轻重的作用。　　 本文采用构建土壤细菌16S rDNA克隆文库，分析了内蒙古浑善达克沙地与毛乌素沙地BSCs中细菌系统发育多样性,以期明确浑善达克沙地与毛乌素沙地土壤细菌菌群结构变化特征、规律，及其与结皮形成演替的关系。　　 在所构建的s个文库(浑善达克沙地包括：样品H1-采自08年11月，H2-09年4月，H3-09年6月，H4-09年8月：毛乌素沙地：样品M-09年8月)中，细菌类群组成比较相似，均包括13个亚门，主要是革兰氏阴性的 proteobacteria(包括a、β、γ、δ和ε所有亚门)和阳性的Bacteroidetes。在所有文库中，α-proteobacteria，Actinobacteria，Cyanobacteria和Bacteroidetes均为优势菌群。其中a-变形杆菌门中的鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)数量最多(在文库H1，H2，H3，H4，M中分别占总菌数的比例为14 .5％，14％,15.2％，28％，30％)，蓝细菌(Cynaobacteria)所占比例分别为：1.8％，2.3％，4.4％，5.4％，22％;而不动杆菌属(Acinetobacter)在总菌数中分别占18.2％，6.9％，6.5％，6.5％和41％。　　 文库中还存在热微菌门(Thernomicrobia)，衣原体门(chlamydiae)，厚壁菌门(Firmicutes)，绿弯菌门(Chloroflexi)，TM7 门，β、ε、δ-变形菌纲8种类群。　　 本文所研究细菌群落组成特征明显不同于成熟BSCs。因此，在BSCs早期发育或重建早期时期，起先锋拓殖作用的可能是Cyanobacteria之外的其他异养和自养细菌。本研究可促进对BSCs微生物多样性及其生态作用的理解和认识，为荒漠化土壤的生态系统恢复提供基础理论依据和技术支持。