中药现代化研究涉及内容十分广泛。构建高通量的样品提取、分离和鉴定平台及发展新型数据处理方法是其至关重要的研究方向。采用高效液相色谱—二级质谱联用(HPLC-MS/MS)技术,发展了红豆杉中紫杉醇以及石芽茶中黄酮类化合物的分析方法。基于十通阀/定量环接口,构建了2D-HPLC-APCI-MS/MS联用系统,并对石芽茶进行了全分析。共鉴定出57个组分,总系统峰容量达到1240。为进一步发展中药的新型分离鉴定系统奠定了方法学基础。以切换阀/捕集柱为接口,根据样品在流路中输运特征的差异,构建了两种新型的超临界流体萃取-高效液相色谱(SFE-HPLC)在线联用系统。不仅可以消除离线分析时样品损失、降解和污染的问题,而且还能对连续时间段的萃取产物进行快速分析检测。从而可以有效监控萃取过程,为优化萃取工艺条件提供实验数据。将构建的联用系统应用于灵芝子实体的高效萃取、分离分析和实时监控,取得了良好效果。针对中药组分的复杂性,构建了新型的SFE-2D-HPLC-APCI-MS/MS在线联用系统,实现了样品的预处理、分离、检测和鉴定的集成。采用该系统发展了灵芝子实体的全分析方法,分离鉴定出73种化合物,总系统峰容量达到1643。结果表明,该系统具有高峰容量、高分离能力、高定性能力、高灵敏度和高通量等优点,可以广泛用于中药研究。通过结合相似度软件和主成分分析(PCA)法,对六味地黄丸的HPLC精细指纹图谱进行了模式识别研究,实现了不同来源与工艺所生产的六味地黄丸的鉴别。结合PCA法和偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)法,对不同种类、不同厂家以及不同批次的人参和西洋参产品进行模式识别研究。结果表明,可根据产品性质的不同实现很好的分类,并将未知样品的预测准确度提高到91.7%,达到了采用单一方法难以达到的效果。