靶向PD-1/PD-L1相互作用小分子抑制剂的筛选及其抗肿瘤活性研究

来源 :兰州大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:ptcptsu
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
肿瘤免疫治疗具有治疗多种类型肿瘤的潜力,且具有持久反应和低毒性,可实质性改善患者总生存期,是肿瘤有望治愈的一个开端。一系列免疫检查点抑制剂的发现为肿瘤治疗装备了新颖而强大的“武器”,它们可以通过封闭抗原呈递细胞和T细胞之间抑制信号通路的传递,重新恢复T细胞的免疫应答,对肿瘤细胞发动攻击和杀伤。其中,程序性死亡-1(PD-1)/程序性死亡配体1(PD-L1)是免疫治疗领域最有前景的靶点之一。作为免疫检查点抑制剂,尽管PD-1/PD-L1单克隆抗体已在各类肿瘤治疗领域彰显其优势,但抗体类药物存在诸多的限制,在肿瘤应答率等方面仍具巨大挑战,故而强调了当前开发小分子抑制剂的迫切性和必要性。然而,由于PD-1与PD-L1间的蛋白-蛋白相互作用(PPI)的典型特征,使得设计和开发临床有效的小分子药物极具挑战。利用虚拟筛选技术从大量已知的化合物中挑选特定靶标的潜在结合物,再进一步结合生物实验对筛选到的化合物进行活性验证已成为一种常规的新药研发策略。本论文利用分子对接的虚拟筛选方法,快速筛选出化合物进行一系列的实验验证,从分子水平,细胞水平到动物学水平系统评价苗头化合物的PD-L1靶向活性,并阐释其作用机制,层层展开PD-1/PD-L1小分子抑制剂的研究。第一部分,从Specs化合物数据库中筛选出能与h PD-L1蛋白相互作用且抑制PD-1/PD-L1相互作用的苗头化合物。首先,我们从h PD-L1与小分子配体复合物的晶体结构(PDB代码:5J89)出发,借助基于分子对接的虚拟筛选策略从Specs数据库中筛选到了93个化合物进入生物活性实验测定。应用表面等离子体共振(SPR)和均相时间分辨荧光(HTRF)实验,共鉴定出5个小分子化合物能在分子水平上与h PD-L1结合,并且能够有效抑制PD-1/PD-L1的相互作用,具有微摩尔水平的活性。其次,基于流式细胞术的抑制实验,我们发现化合物APBC(SPECS No.AG-690/11449006)和CBPA(SPECS No.AN-465/42833793)具有新颖的骨架结构,能够有效的抑制细胞膜表面PD-1/PD-L1相互作用。再次,我们通过荧光素酶实验和T细胞功能实验证实,APBC和CBPA均能通过抑制PD-1/PD-L1的相互作用,实现T淋巴细胞的重新激活,浓度梯度依赖性增强其释放细胞因子IFN-γ和TNF-α的能力,逆转PD-L1介导的T细胞免疫抑制作用。以上实验结果表明,APBC和CBPA可作为具有潜力的苗头化合物,其体内活性值得进行更深入的探索。第二部分,构建小鼠肿瘤模型研究苗头化合物在复杂生理条件下的抗肿瘤效果,并探讨苗头化合物的作用机理。首先,基于小鼠肿瘤模型,我们发现化合物APBC和CBPA在10mg/kg的剂量下均对不同组织类型肿瘤有良好的抑制作用。而后,转录组学分析发现APBC和CBPA可以降低肿瘤的有氧糖酵解代谢通路,并且显著提高了免疫相关信号通路。通过流式细胞术和免疫组化对小鼠脾脏T淋巴细胞亚群和细胞因子分泌进行检测,发现APBC可以显著提高脾脏CD3+CD4+,CD3+CD8+T淋巴亚群比例,并且提高脾脏T淋巴细胞分泌细胞因子穿孔素(Perforin),TNF-α和IFN-γ的能力。但是CBPA对脾脏T淋巴细胞亚群分布和细胞因子的分泌无显著影响,这表明APBC能促进系统免疫,而CBPA不具有此作用。同时,流式分析和免疫组化结果显示,APBC和CBPA治疗可以显著促进肿瘤组织中CD4+和CD8+T细胞的浸润,并且诱使肿瘤微环境中细胞毒性因子包括颗粒酶B(Gzm B)和Perforin的水平显著增加。这些炎性细胞因子相互协调作用,可将更多的T细胞募集到肿瘤微环境中,从而形成拮抗肿瘤生长的正反馈回路。综上,这些结果表明了小分子化合物APBC和CBPA可通过阻断PD-1/PD-L1 PPI来重新激活肿瘤浸润T淋巴细胞,进而发挥有效的抗肿瘤活性。第三部分,对化合物APBC和CBPA的生物安全性和体内的代谢稳定性进行了初步考察,并通过分子动力学模拟探讨这两个苗头化合物与PD-L1的相互作用模式。细胞实验和体内血液生化指标检测证实APBC和CBPA均具有良好的生物安全性,治疗剂量和高剂量给药(50 mg/kg)均未引起明显的肝肾毒性,特别是APBC具有更好的生物安全性。APBC和CBPA的代谢特征显示,二者均具有很好的血浆稳定性,但APBC在体外人肝微粒体中代谢较快(T1/2=17.4 min),CBPA具有中等的肝微粒稳定性(T1/2=44.6 min)。这提示我们在后期对化合物APBC和CBPA结构优化的过程中,既要考虑提高原有活性,同时也需要封闭或修饰代谢位点,提高肝代谢稳定性。基于CYP450酶抑制实验的药物相互作用风险评估显示,APBC对人CYP1A2酶有较强的抑制作用,CBPA对CYP1A2,CYP2C9,CYP2C19,CYP2D6酶有较强的抑制作用,这提示在联合用药时,需要考虑到与其它以上述酶为代谢主通路的药物相互作用风险。最后,分子动力学模拟结果表明,APBC和CBPA可能通过PD-L1二聚体锁定模式,阻断PD-L1和PD-1相互作用表面发挥作用。范德华相互作用和静电相互作用是小分子和PD-L1蛋白二聚体相互作用的主要驱动力。此外,APBC与A链上的A121和D122形成了两个氢键相互作用,CBPA与B链上的Q66形成了一个氢键相互作用,氢键相互作用的多寡和强弱直接影响结合能力,这说明在后续的苗头化合物结构优化过程中适当的增加配体分子类似的氢键供体和受体,很有可能质的提高苗头化合物的活性。探讨我们苗头化合物的优势和仍存在的问题,将为我们后期针对不同的结合位点进行结构改造提供有益的线索和依据。综上所述,APBC和CBPA的发现丰富了PD-1/PD-L1小分子抑制剂的多样性,可作为具有潜力的苗头化合物进一步设计和开发PD-1/PD-L1通路的强效抑制剂,为免疫治疗药物研发奠定坚实的基础。
其他文献
先秦道家思想开启了大自然万物同生共运、浑然一体的“大生命”宇宙论视域,“道”、“天”、“地”、“人”构成了道家宇宙论的“四大”主轴。道家追问生命现象产生的本原和依据,将这个本原归之于“道”。“道”包含了对生命现象、生命活动的多方位理论提炼。“道”是万物的本原,也是万物运行的总规律、总法则,从“生物”个体的角度,生命运行自有其殊异之理,从“万物”的角度,“道”是天地万物运行的整体法则。中国古代思想史
学位
海洋作为地球上最大的生态系统,可容纳96.5%的水资源和80%的生物质资源。甲壳素是海洋中最丰富的天然多糖,主要来源于海洋甲壳类动物。由于它储量丰富,同时具有生物活性、生物安全和生物可降解等优点,甲壳素基功能材料的研究和开发日益引人注目。本论文主要以甲壳素及其衍生物壳聚糖为原料,通过简便、绿色的方法构筑甲壳素功能水凝胶,同时采用扫描电子显微镜(SEM)、偏振光学显微镜(POM)、固体核磁共振碳谱(
学位
慢性炎症和很多重大疾病的发生发展密切相关并与这些疾病相互影响。例如脑内持续的炎症会造成神经细胞的损伤或坏死,导致神经功能障碍,进而引发神经退行性疾病。再如,慢性炎症还诱导细胞DNA损伤和促癌基因的转录,导致肿瘤的发生和恶性进展。因此,开发治疗慢性炎症或肿瘤炎性微环境的药物具有重要的临床应用价值。本文根据拼合原理,设计合成了一系列基于褪黑素衍生物的多功能COX-2抑制剂和COX-2/STAT3双抑制
学位
本文主要考虑时间分数阶扩散波方程(TFDWE)中的以下几类反问题:同时反演初值的问题,同时反演阶数与零阶项系数的问题,同时反演阶数与对流项系数的问题,最后给出了一种求解线性反问题的预处理交替方向乘子法(ADMM),并成功应用到了源项的反演问题中。在第一部分中,我们研究了TFDWE中利用Cauchy数据同时反演两个初值的反问题。通过Laplace变换和解析延拓的方法,我们证明了该反问题的唯一性,然后
学位
高次谐波的产生是强场物理中非常重要的一种非线性光学现象。该现象囊括阿秒尺度的电子电离、加速和再散射过程,是经典力学和量子力学的独特结合。在阿秒物理中,高次谐波是探测原子分子内超快动力学的一种重要手段。这种探测技术一方面基于高次谐波频谱的基本性质,另一方面基于特殊形式的激光场对电子轨迹的控制。本论文通过数值求解含时薛定谔方程同时结合理论模型的定量分析,研究高次谐波谱的两个重要性质,即谐波产生中的奇偶
学位
科学计算和工程应用中的诸多领域,如流体力学,结构力学,约束最优化,电磁学,图像恢复,信号处理,控制理论和系统理论等,都与线性系统的求解息息相关.因此,根据系统的结构和特点设计出稳定,高效的数值算法具有十分重要的理论意义和实际应用价值.本论文主要研究了两类线性系统的求解,一类是具有奇异,非Hermitian半正定系数矩阵的大型稀疏线性方程组的数值求解,另一类是线性矩阵方程的数值求解及应用.首先,我们
学位
明代是古典文献走向集中定型的时代,在创作激情高涨、创作者与作品不断增加的氛围下,“集部”之学开始兴盛。从明代到清代,王阳明文献的编选渐成一系,其中有整理语录汇辑成册的如薛侃《阳明先生则言》、李贽《阳明先生道学钞》、周汝登《王门宗旨》以及孟津《良知同然录》等。有关注王阳明政治才能的如陈龙正《阳明保甲法》《阳明乡约法》的汇辑,有专门收集阳明诗文的文选,如明刻本《王阳明诗录》、俞长城辑《王阳明稿》、凤山
学位
声波传输特征值问题和逆散射中Steklov特征值问题在逆散射理论中扮演着重要的角色.声波传输特征值问题出现在非均匀介质的逆散射理论中,具有重要的物理背景和广泛的应用.由于传输特征值能够由远场数据所确定,因此它可以被用来估计散射物质材料的性质.Steklov特征值问题在特征值问题的研究中占有重要地位.近年来,在逆散射理论中出现了一种非自共轭的Steklov特征值问题,吸引了很多学者的关注.这两类问题
学位
干旱区(drylands)约占全球陆地表面积的41%,维系了全球超过38%的人口,是地球陆地生态系统的重要组成部分并且在农业和社会经济发展中占有重要地位。土壤微生物,譬如古菌、细菌、真菌等,是干旱区地下生物群落的主要组分,驱动了诸如气候调节、生物量生产、碳固持、养分循环、土壤肥力等多项重要的生态系统功能和过程,进而决定了干旱区为人类社会提供产品和服务的能力。近几十年来,全球气候变暖对干旱区生态系统
学位
膨润土缓冲回填屏障作为高放废物深地质处置的重要人工屏障,与外部的天然围岩结构形成一个严密的包封体系,阻滞核素向外迁移,保证整个屏障体系的可靠性。缓冲回填屏障一般由膨润土或膨润土混合物通过现场压实,或者采用预制压实砌块现场拼装而成。其中,对于采用预制拼装的屏障结构,砌块与砌块之间、砌块与围岩之间以及砌块与废物处置罐之间都无法实现完全的“严丝合缝”,存在不同形状、不同尺寸的多维度施工接缝。接缝会成为地
学位