结核分枝杆菌Csm1和Cas6的功能研究

来源 :中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ks00459
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
CRISPR/Cas系统是原核生物中的一种依赖于核酸的获得性免疫系统,用来抵抗外源遗传物质的入侵。该系统对于外源基因入侵的抵御机制主要依靠crRNA-Cas蛋白效应复合物,在crRNA的引导下,复合物可以特异性地识别并切割外源DNA或RNA。  Csml是TypeⅢ-A CRISPR/Cas系统效应复合物中的重要蛋白,具有核酸酶活性,在抵御入侵的过程中切割外源DNA。生物信息学预测发现,Csml中含有Palm结构域、Thumb-like结构域和锌带结构等特殊位点,推测Csml可能具有聚合酶的活性。然而,对Csml聚合酶活性的鉴定工作一直未有报道。  本课题第一部分以结核分枝杆菌MtbCsml为研究对象,发现其具有DNA聚合酶活性,并进一步研究了该蛋白的聚合活性特点。首先,我们在体外利用引物延伸方法,发现MtbCsml可以有效地延伸DNA引物链。其次,通过筛选不同二价金属离子对Csml聚合活性的影响,发现该蛋白的聚合酶活性具有Mg2+依赖性。最后,我们还构建了MtbCsml的突变体,发现位于Palm结构域的GGDD motif对于蛋白的聚合酶活性具有重要作用。  此外,我们还研究了MtbCsml的核酸酶活性。实验发现,该蛋白的核酸酶活性同样具有Mg2+依赖性,可以有效切割单链DNA、5-overhang和3-overhang等类型底物。  在TypeⅠ和TypeⅢ型CRISPR/Cas系统中,Cas6蛋白家族作为一类核糖核酸内切酶,能够在CRISPR区域前体转录物内的repeat序列处进行特异性切割,从而产生成熟的crRNA。然而,至今未有研究显示结核分枝杆菌的MtbCas6蛋白确实参与crRNA的生成。在本课题里,我们发现结核分枝杆菌成熟crRNA的大小为71nt左右,其3端repeat片段未被第二次加工,该现象区别于其他TypeⅢ系统。通过repeat RNA切割实验,我们还发现MtbCas6蛋白是一个依赖于二价金属离子的,具有序列和结构特异性的核糖核酸内切酶,其倾向于特异性切割repeat RNA。MtbCas6切割repeat RNA位点为距离其3端8nt处,与RNA-Seq结果一致。另外,体内试验证实MtbCas6确实参与了crRNA的生成,并且在抵御外源基因入侵方面发挥重要作用。  本课题首次检测了结核分枝杆菌Csml和Cas6蛋白的活性,并发现了MtbCsml的DNA聚合酶新活性和MtbCas6离子依赖性特点,丰富了CRISPR/Cas系统的认识。
其他文献
大量分布式新能源接入配电网缓解了用户对电力供应的需求;但也会影响配电网中的潮流分布以及电流大小;从而会影响原有配电线路保护的动作可靠性。因此,本文针对分布式电源接入对配电线路过流保护产生的影响进行分析,并基于此影响对其过流保护方案进行研究。分布式电源接入将配电线路分为接入点上游、下游和相邻线路三部分,当故障分别发生在这三部分时,对配电线路过流保护产生的影响分别进行了理论分析和仿真实验,结果表明:随
本文通过对荣华二采区10
期刊
ZNF268基因是我们在以构建早期人胚胎cDNA文库的基础上,从3-5周龄人胚胎cDNA文库中得到一个典型的Cys_2/His_2型锌指基因。在早期的研究中,我们采用NORTHERNBLOT及WESTERNBLO
生境是动物野外生存的外在条件,对野生动物的个体,种群甚至相关生物群落的生存和发展起着决定性的作用。保护物种赖以生存的生境对物种的保护至关重要。黑白仰鼻猴(Rhinopithecu
太阳是一个蕴藏着巨大能量的恒星,它的内部时时刻刻都在发生着激烈的变化,释放着能量。以十一年为一个周期,它就会进入一次表面活动旺盛时期。伴随着太阳内部的剧烈活动,它就必然会冲击地球的自身磁场,引发地磁场的剧烈波动,这就引发了人们所熟知的地磁暴。地磁暴若足够大,就会给电力系统的运行带来威胁。而作为保护电网安全稳定运行的重要一环,电流互感器在磁暴期间能否准确的把故障电流转换到二次侧的保护装置让其及时动作
随着旅游业的快速发展,越来越多的流域景观资源被旅游开发利用,对自然生态系统的压力和影响也越来越大.但国内外缺乏有关旅游干扰对生态系统影响机理、流域景观保护等方面的
配电监测系统是提高电力系统运行自动化程度和供用电的质量及可靠性的重要组成部分,是实现配网自动化的首要步骤。只有对配电设备的运行参数和状态进行实时监测,才能够在配网发生故障或异常运行时,迅速查出故障区域及异常情况,快速隔离故障区域,并控制电网潮流及负荷分配,改善电压质量,达到经济运行目的。本文针对宣城地区电网的具体建设情况,主要针对宣城电网配电自动化中的配电监测系统进行分析与设计。在学习配电监测系统
无刷直流电机(Brushless DC Motor,BLDCM)因其结构简单、调速性能好、运行可靠,在家电、电动车和工业等领域得到了广泛应用。BLDCM无位置传感器控制省略了位置传感器,避免了位置传感器安装使用带来的不利影响,因此受到人们的极大关注。本文以电动三轮车用BLDCM为被控对象,对BLDCM无位置传感器控制系统进行分析与研究。本文首先对BLDCM的组成结构和工作原理进行研究,且推导了其数
冬天的中原大地,凛冽的寒风把一树的叶子打落,暴露出一个个高耸树梢的鸟窝;瑟瑟的平原上除了一望无际的麦苗绿,就是那层层叠叠的农家院落.rn黄河北,七里营,毛主席视察田.老吕
银叶树是一种既能生长在潮间带,也能在陆地上生长的"两栖性"红树植物,其对生长环境的特殊适应性具有重要生态学价值和保护意义.虽然银叶树在亚洲、澳洲和非洲均有分布,但由于