MyoG、GH和CKM基因多态性及其与藏羊生长发育性状的关联性分析

来源 :青海师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:huahongtao
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本试验以贵南县黑藏羊(GN),祁连县高原型藏羊(QL),河南县欧拉型藏羊羊(HN)共632只羊血液为研究对象,采用PCR-SSCP分子标记方法结合DNA测序对MyoG、GH和CKM基因的多态性及其与藏羊生长发育性状的相关性进行分析,目的在于探索MyoG、GH和CKM基因对藏羊生长发育的影响,筛选出了对藏羊生长发育有重要影响的功能基因和分子标记,以期为藏羊的育种提供重要的理论依据。MyoG基因在3个藏羊群体中检测到2个突变位点,分别为g.109A>C(第1外显子)和g.1403A>C(第1内含子);GH基因在所研究群体中检测到3个突变位点,分别为g.498G>C(第2外显子)、g.616G>A(第2内含子)和g.624G>A(第2内含子);CKM基因在所研究群体中检测到2个突变位点,分别为g.8068C>G(第6内含子)和g.8322A>G(第7内含子);各位点的突变情况及不同基因型与生长性状的相关分析结果如下所示:1.藏羊MyoG基因多态性与生长性状的关联分析藏羊MyoG基因g.109A>C位点检测到CC、CA、AA三种基因型,该突变引起MyoG基因37号位谷氨酸(GAG)→丙氨酸(GCG)的错义突变;该突变位点在3个群体中为中度多态;相关性表明在HN群体中CC基因型的体重、体高和体长显著高于AA基因型个体(P<0.05),QL群体中CC基因型体重显著高于AA基因型(P<0.05),GN群体中CC基因型个体的体高和体长显著低于AA基因型(P<0.05)。g.1403A>C位点检测到AA、AC和CC三种基因型,相关性表明HN群体中AA基因型的体重和体高显著高于CC基因型个体(P<0.05),QL群体中AA基因型的体重和体长显著高于CC基因型(P<0.05)。2.GH基因多态性与生长性状的关联分析g.498G>C位点存在GG、GC和CC 3种基因型,为87号位脯氨酸到脯氨酸的同义突变,GG和G分别为优势基因型和优势等位基因,该位点3个地方群体的藏羊均偏离哈代-温伯格平衡状态,中度多态水平;相关性表明HN群体中GG基因型体重和体长极显著高于CC基因型(P<0.01),QL群体中GG基因型的体重、体高、体长和胸围极显著高于CC基因型(P<0.01),GN群体中GG基因型的体重和体长显著高于CC基因型(P<0.05)。g.616G>A存在GG、GA和AA 3种基因型,GG和G分别为优势基因型和优势等位基因,中度多态水平。相关性表明HN群体中AA基因型的体重和体长显著高于GG型(P<0.05),体高和胸围极显著高于GG型(P<0.01);QL群体中AA基因型体长极显著高于GG型(P<0.01);GN群体中AA基因型体重显著高于GG型(P<0.05)。g.624G>A位点存在GG、GA和AA 3种基因型,GG和G分别为优势基因型和优势等位基因,位点间遗传纯合度表现为祁连县高原型藏羊>群体河南县欧拉羊群体>贵南县黑藏羊群体,中度多态水平。该位点的各个基因型在3个群体中对体重、体高、体长和胸围4个生长性状无显著性影响(P>0.05)。3.CKM基因多态性与生长性状的关联分析g.8068C>G位点存在CC、CG和GG 3种基因型,GG和G分别为优势基因型和优势等位基因,为中度多态,在3个地方的藏羊群体均处于哈代-温伯格不平衡状态;相关性表明HN群体中CC基因型体重显著高于GG型(P<0.05),体高极显著高于GG型(P<0.01),QL群体中CC基因型的体重、体高和胸围显著高于GG型(P<0.05),GN群体中CC基因型体重和体长极显著高于GG型(P<0.01)。g.8322A>G位点存在AA、AG和GG 3种基因型,AA和A分别为优势基因型和优势等位基因,为中度多态,在3个地方的藏羊群体均处于哈代-温伯格不平衡状态,该突变位点对藏羊生长性状没有显著影响。
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