毛尖紫萼藓GH120、GH425基因的克隆与生物信息学分析

来源 :齐齐哈尔大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:along_1979
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毛尖紫萼藓(Grimmia pilifera)属于紫萼藓科(Grimmiaceae)紫萼藓属(Grimmia),植物体多深绿色或紫黑色,多生于高山岩石面或岩石薄土,是一种耐旱藓类。它可以抵御极端干旱并在干燥几年后重新给水后瞬间恢复活力,是研究植物体对干旱应答重要的研究材料。本研究在以SMART技术构建了毛尖紫萼藓干旱诱导的cDNA文库的基础上,从中挑选了一个Cu/Zn-SOD基因和一个真核细胞启动因子4E基因(eukaryotic translation initiation factor 4E),分别采用了RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)技术与电子克隆技术,克隆了2个基因的全长。并对目的基因序列进行了验证工作和生物信息学分析,旨为进一步揭示毛尖紫萼藓在抗干旱过程中的分子及其功能奠定理论基础。采用RACE技术克隆了一个编码Cu/Zn-SOD的基因GH120。序列分析表明,该基因全长726bp,包含一个完整开放阅读框架,长为465bp,编码154个氨基酸,包含两个功能性位点。该基因编码蛋白与小立碗藓、北美云杉、樟子松、轮叶党参、宫灯百合等多种植物的Cu/Zn-SOD高度同源,其中与小立碗藓亲缘关系最近。采用电子克隆技术克隆了一个编码真核细胞启动因子4E的基因GH425。序列分析表明,该基因全长1288bp,包含一个完整开放阅读框架,长为726bp,编码241个氨基酸,包含一个功能性位点。该基因编码蛋白与与小立碗藓、北美云杉、玉米、日本籼稻、拟南芥等多种植物的eIF4E高度同源,其中与小立碗藓亲缘关系最近,与北美云杉亲缘关系次之。
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