基于生物信息学方法探讨NID2在胃癌中的表达与临床意义

来源 :锦州医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ddlin2121
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目的NID2参与多种肿瘤的发生发展,但其在胃癌中的作用尚未清楚。本研究通过生物信息学与免疫组化的方法研究NID2在胃癌(GC)中的表达及其临床意义。以此探究NID2是否有潜力成为治疗胃癌的新型靶点。方法首先通过Oncomine在线数据库分析NID2在胃癌和正常组织中的差异。再利用Linked Omics在线数据库找到其正相关基因并导入David数据库对其进行功能注释和通路分析。进一步通过String数据库和Cytoscape软件共建蛋白互作网络(PPI)。通过GEPIA数据库分析NID2的表达与不同分期胃癌的关系和患者生存预后的关系。利用TIMER数据库研究NID2与免疫细胞浸润的关系。使用UALCAN数据库探讨NID2在胃癌中甲基化的情况。最后采用免疫组化方法验证胃癌中NID2的表达情况。结果NID2在胃癌中的表达明显高于正常组织(P<0.05)。功能富集注释和通路分析显示NID2及其正相关基因主要与胶原纤维组织、细胞对氨基酸刺激的反应、细胞黏附、ECM-受体相互作用、蛋白质消化吸收、局灶性粘连、PI3K-Akt信号通路、阿米巴病等有关。GEPIA数据库表明NID2在胃癌中表达水平显著升高(P<0.05),且不同分期差异显著(P<0.05)。高表达组的生存率明显低于低表达组(P<0.05)。NID2还有可能与免疫细胞的浸润有关。免疫组化结果显示:NID2在胃癌组织中的阳性率为92.6%,明显高于癌旁组织的阳性率51.8%,但是与性别、年龄、肿瘤大小、淋巴结转移、分期和分化程度无关。结论NID2可能参与胃癌的发生发展,免疫细胞浸润且与患者预后有关,有望成为胃癌患者早期诊断、治疗及判断预后的分子靶标。
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