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本研究基于传统微生物平板分离培养和高通量测序技术分析,对贵州遵义县、湖南慈利县和四川旺苍县3个道地药材杜仲相关真菌群落组成及对其活性成分的影响,结合3个产地土壤理化因子及杜仲几个主要活性成分进行相关分析,探究不同产地杜仲根际真菌、内生真菌群落组成是否存在地理差异,以及这些差异是否与地理土壤组成和杜仲的几个活性组分存在关联,获得以下研究结论:基于传统真菌平板分离培养结果可知,不同产地杜仲树皮内生及根际土真菌群落组成有明显差异,3个产地杜仲树皮内分离到真菌111经分子鉴定为13属,其中,拟茎点霉属Phomopsis、链格孢属Alternaria、间座壳属Diaporthe为3个产地的共有属,优势菌群为间座壳属Diaporthe。杜仲根际土真菌有187个菌株,经分子鉴定为20个属,3个产地的优势菌群均为青霉属Penicillium。基于高通量测序技术对采自贵州遵义县、湖南慈利县和四川旺苍县3个产地杜仲根际土壤的真菌群落组成进行了分析。研究获得根际土壤真菌有效序列共10 775条,聚类后OTUs对应的真菌类群涉及子囊菌门Ascomycota、担子菌门Basidiomycota、接合菌门Zygomycota、球囊菌门Glomeromycota、壶菌门Chytridiomycota、类原生动物门Rozellomycota的22纲、59目、103科、108个属的550个真菌分类单元(OTUs)。在属的水平上,湖南慈利样本(ECS)有119个属,优势属为镰刀菌属Fusarium,相对丰度为16.31%,其次是被孢霉属Mortierella(14.67%)、毛壳菌科Chaetomiaceae中一未定属(13.01%)和木霉属Trichoderma(11.37%)等。四川旺苍样本(EWS)共有116个属,优势属为丝齿菌属Hyphodontia,相对丰度32.32%,其次为镰刀菌Fusarium(13.41%)等。贵州遵义样本(EZS)有110个属,优势属为被孢霉属Mortierella,相对丰度30.74%,其次是木霉属Trichoderma(25.96%)和镰刀菌属Fusarium(4.85%)等。α多样性分析表明,不同产地杜仲根际土壤真菌群落组成有明显差异。遵义样本(EZS)、慈利样本(ECS)和旺苍样本(EWS)的Shannon多样性指数从高到低为:ECS(2.7661)>EZS(2.4841)>EWS(2.1326)。杜仲根际土壤样品真菌物种组成丰富,不同地区杜仲根际土壤真菌群落组成、分类单元的相对丰度及优势分类单元皆存在不同程度差异。基于高通量测序及宏基因组分析法对3个产地的杜仲树皮内生真菌的群落组成及生态功能结构进行分析。从所试样本中共获得内生真菌有效序列11 0865条,聚类后OTUs对应的真菌类群涉及子囊菌门Ascomycota、担子菌门Basidiomycota、接合菌门Zygomycota的10纲、25目、41科、57个属的74种真菌。其中,四川旺苍样本(EWP)中优势属为丛赤壳科Nectriaceae中的未定属,相对丰度为55.03%。湖南慈利样本(ECP)中优势属为子囊菌门Ascomycota中的未定属,相对丰度为40.23%。贵州遵义样本(EZP)中优势属为扁孔腔菌Lophiostoma,其相对丰度为47.15%。α多样性分析表明,不同产地杜仲树皮内生真菌Shannon多样性指数从高到低依次为,EZP(1.3804)>ECP(1.3402)>EWP(1.1683);Simpson多样性指数从高到低依次为,EWP(0.4273)>EZP(0.3325)>ECP(0.3136)。经FUNGuild软件平台解析,3个产地的杜仲树皮内生真菌包含14个生态功能群,即植物病原菌群、动物病原菌群和内生真菌群等,3产地杜仲样本的共有功能群数达到8个,超过了总数的二分之一。不同杜仲产区土壤理化因子及4个主要活性成分(松脂醇二葡萄糖苷、绿原酸、京尼平苷酸和京尼平苷)与根际土真菌群落组成的相关性分析表明,4个主要活性成分皆为四川旺苍(EWS)产地含量最高,其次是湖南慈利,贵州遵义最低甚至不含京尼平苷。对不同产地活性成分和土壤根际真菌分类单元两者之间的相关性分析表明,在四川旺苍样本(EWS)中,松脂醇二葡萄糖苷及绿原酸含量与根际真菌中一些未界定的真菌、丝齿菌属Hyphodontia、土赤壳属Ilyonectria、镰刀菌属Fusarium和紫孢菌属Purpureocillium有不同程度的正关联,杜仲根际土真菌群落结构的多样性与土壤理化因子及杜仲主要有效成分含量具有一定相关性,一定程度上表明根际真菌群落组成影响杜仲活性成分的合成。杜仲根际土真菌群落组成的结构谱是杜仲道地性的重要特征。对杜仲皮内生真菌群落与四种活性成分进行了相关性分析,发现在四川旺苍样本(EWP)中,松脂醇二葡萄糖苷及绿原酸含量与内生真菌中大卫氏菌科Davidiellaceae中的未定属、被孢霉属Mortierella、毛壳菌属Chaetomium和拟盘多毛孢属Pestalotiopsis有不同程度的正关联。