甘蓝型油菜细胞质及芸薹属A基因组遗传多样性研究

来源 :西北农林科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sirius1394
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甘蓝型油菜是世界及我国重要的油料作物。甘蓝型油菜的遗传基础相对狭窄,可利用基因资源匮乏,遗传多样性比较低。因此,拓宽甘蓝型油菜的遗传背景意义重大。本文利用细胞质特异分子标记分析了 181份甘蓝型油菜材料的遗传多样性;利用A基因组特异的SSR分子标记分析了 68份甘蓝型油菜、46份白菜型油菜和13份芥菜型油菜的遗传多样性。所得研究结果如下:1.利用细胞质特异一步多重PCR标记及细胞质特异SSR分子标记对181份甘蓝型油菜细胞质遗传多样性进行了分析。结果表明,181份甘蓝型油菜中110份材料为Nap细胞质类型,52份材料为Pol细胞质类型,19份材料为Cam细胞质类型。24对细胞质特异SSR引物中有5对引物可以扩增出多态性条带,其中4对为叶绿体引物,1对为线粒体引物,它们共扩增出13条多态性条带,每对引物扩增出的多态性条带数从2到4不等,平均每对引物扩增出2.6条多态性条带,多态性信息含量值(PIC)从0.364到0.671不等,平均为0.442。根据5对细胞质特异SSR引物对所有参试材料的扩增结果,将181份甘蓝型油菜材料分为7种单倍体型,依次命名为BnH1-BnH7,19份Cam材料中有3种单倍型,其中17份材料为BnH1;52份Pol材料中有3种单倍型,其中50份为BnH2;110份Nap材料有3种单倍型,其中104份Nap材料为BnH6。聚类分析将参试材料分为两大类,第一类包括所有的Cam细胞质类型材料,51份(98.08%)Pol细胞质类型材料,以及2份Nap细胞质类型材料,第二类主要为Nap细胞质类型材料。聚类分析结果表明,Cam细胞质与Pol细胞质的亲缘关系较与Nap细胞质的亲缘关系更近一些。2.从192对SSR引物中筛选出15对多态性引物,它们在127份参试的甘蓝型油菜、白菜型油菜及芥菜型油菜中共检测到58条多态性条带,每对引物扩增多态性条带数从2到7不等,平均3.87条,多态性信息含量值(PIC)从0.173到0.831不等,平均为0.567。聚类分析将参试的127份材料分为两类,第一类包括所有参试的甘蓝型油菜,第二类包括所有参试的白菜型油菜和芥菜型油菜,第二类中白菜型油菜和芥菜型油菜也基本分开。主成分分析、群体结构分析与聚类分析结果相似。分子方差分析结果显示种群间方差分量比例为36.86%,种群内方差分量比例为63.14%。种群遗传分化结果显示,甘蓝型油菜与白菜型油菜之间遗传分化指数Fst值为0.3491,甘蓝型油菜与芥菜型油菜之间为0.4192,白菜型油菜与芥菜型油菜之间为0.3645,甘蓝型油菜与芥菜型油菜之间的分化程度较高。上述结果表明,利用白菜型油菜、芥菜型油菜改良丰富甘蓝型油菜(A基因组)遗传多样性还有较大余地。
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