基于高通量测序技术的溃疡性结肠炎及回肠贮袋患者肠道菌群的实验研究

来源 :天津医科大学 | 被引量 : 4次 | 上传用户:juyang0303
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:分析溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)、末端回肠造口及全结直肠切除、回肠贮袋肛管吻合术(ileal pouch anal anastomosis,IPAA)术后回肠贮袋患者肠道菌群结构、丰度及多样性变化,探讨肠道菌群介导的UC及贮袋炎发生的微生物学机制。方法:连续选取2017年12月~2018年12月期间在天津医科大学总医院普通外科、消化内科病房及门诊,并接受结肠镜和组织病理学检查且符合条件的UC患者37例、末端回肠造口患者14例及IPAA术后回肠贮袋患者16例,分别记作UC组、造口组和贮袋组;选择同时期性别年龄相匹配的健康人18例作为健康对照组,收集上述4组大便标本至无菌管中,放置低温冰箱储存备用。按照改良Mayo评分系统将UC组分为缓解期(Aa)、轻度活动(Ab)、中度活动(Ac)及重度活动(Ad)四个亚组;按照贮袋炎活动指数评分(PDAI)将贮袋组分为≥7分的贮袋炎组(Pa)和<7分的非贮袋炎组(Pb)两个亚组;按照基础疾病的不同将造口组分为UC术后造口(Sa)组及非UC术后造口(Sb)组。随后对粪便样本DNA进行抽提质检,PCR扩增及产物提纯,构建文库并上机测序,测序数据采用silva12816s数据库进行物种注释。最后采用α多样性分析物种多样性变化,β多样性分析组间微生物群落结构差异,LEfSe分析寻找组间差异物种。结果:α多样性分析结果显示,UC缓解期患者的肠道菌群多样性与健康人群相似,从轻度活动患者开始,随着疾病活动度的增加,菌群多样性逐渐减少,UC中度及重度活动患者多样性的下降较健康对照者具有统计学意义(p<0.05);回肠贮袋炎患者较非贮袋炎者贮袋物种多样性明显减少(p<0.05);UC术后造口患者的肠道微生物多样性较非UC术后造口者存在下降趋势(p>0.05);UC中度活动患者与贮袋炎患者肠道微生物多样性水平相似,而UC轻度活动和重度活动患者较贮袋炎患者肠道菌群多样性分别呈升高、降低趋势(p>0.05);贮袋炎组与UC术后造口组物种多样性水平相似,而非贮袋炎组的物种多样性与UC术后造口组相比呈现升高趋势(p>0.05)。β多样性分析表明,UC缓解期及轻度活动患者的肠道微生物群落结构与健康对照者相比无明显差异(p>0.05),而UC中度及重度活动患者的肠道细菌群落结构较健康对照人群存在显著不同(p<0.05);贮袋炎患者的菌群结构与非贮袋炎者相比存在显著差异(p<0.05);UC术后造口患者与非UC术后造口者肠道微生物群落结构无明显差异(p>0.05);UC活动期患者与回肠贮袋炎患者的菌群结构存在显著差异(p<0.05);回肠贮袋炎组与UC术后造口组群落结构相似,而非贮袋炎组菌落结构与UC术后造口组的群落结构存在明显差异(p<0.05)。LEfSe分析显示,UC各亚组较健康对照组菌群存在显著差异。与健康对照者相比,UC缓解期患者链球菌属相对丰度明显升高(p<0.05),真杆菌属相对丰度明显下降(p<0.05);轻度患者Mogibacterium相对丰度显著增多(p<0.05),罗氏菌属相对丰度显著减少(p<0.05);中度患者Mogibacterium和Prevotella9相对丰度明显增多(p<0.05),而真杆菌属、布劳特氏菌属和拟杆菌属的相对丰度明显减少(p<0.05);重度患者Lachnoclostridium和消化链球菌属相对丰度显著升高(p<0.05),而真杆菌属、罗氏菌属、布劳特氏菌属、柔嫩梭菌属和拟杆菌属的相对丰度显著下降(p<0.05)。与非贮袋炎者相比,贮袋炎患者埃希菌属丰度显著增多(p<0.05),拟杆菌属和柔嫩梭菌属丰度明显减少(p<0.05)。与非UC术后造口者相比,UC术后造口患者粪便大肠埃希菌明显增多(p<0.05)。此外,本实验发现随着疾病活动程度的增加,拟杆菌属、布劳特氏菌属、罗氏菌属、Lachnoclostridium和消化链球菌属在UC各亚组中丰度呈现明显的变化趋势;在UC活动期和贮袋炎患者中Lachnoclostridium、埃希菌属和柔嫩梭菌属丰度存在明显变化趋势;罗氏菌属、布劳特氏菌属、巨单胞菌属、柔嫩梭菌属、拟杆菌属和大肠埃希菌在UC术后造口与回肠贮袋患者中存在明显变化趋势。结论:UC患者肠道菌群多样性、结构及丰度较健康对照者存在明显差异,拟杆菌属、布劳特氏菌属、罗氏菌属、Lachnoclostridium和消化链球菌属在UC各亚组中丰度呈现明显的变化趋势。贮袋炎患者菌群多样性、结构及丰度与非贮袋炎者相比存在明显差异,贮袋炎患者较非贮袋炎者埃希菌属增多,拟杆菌属和柔嫩梭菌属减少。UC术后造口患者较非UC术后造口患者肠道菌群多样性呈现降低趋势,群落结构无明显差异,UC术后造口患者较非UC术后造口患者大肠埃希菌增多。Lachnoclostridium、埃希菌属和柔嫩梭菌属丰度在UC活动期和贮袋炎患者中存在明显变化趋势。UC患者及贮袋炎患者肠道菌群发生紊乱,有益菌属的减少和有害菌属的增加共同影响肠道及贮袋粘膜,造成肠道及贮袋微生物屏障功能损伤,介导了UC及贮袋炎的发生、发展。
其他文献
目的:1、观察和客观评价天麻芎苓止眩片治疗高血压肾病肝火亢盛、痰热内蕴型患者的治疗效果并探讨其可能的作用机理;2、观察天麻芎苓止眩片对高血压肾病大鼠肾组织氧化应激的
<正> 内蒙古自治区自1947年5月1日成立以来,在中国共产党的领导下已经走过了40年的里程,内蒙古美术,在党的民族政策的光辉照耀下和文艺方针的指引下,也已走过了四十年的路程
我国正处于城市化飞速发展的时期,为了满足城市建设的需要,大量的农村集体建设用地被用于城市建设。但我国现行土地立法规定的土地供给模式存在诸多弊端,农村集体建设用地使用权非法流转现象十分普遍,从而导致的矛盾纠纷重重,严重影响社会经济的健康有序发展,因此我国当前必须加强对集体建设用地使用权流转的监管。本文总共分为四个章节,第一章绪论部分主要论述研究我国农村集体建设用地使用权流转的现实背景与研究的意义,以
为明确常用生物杀菌剂对谷子生长的安全性及对谷瘟病的防治效果,选用3种常用的生物杀菌剂,分别设置低、中、高量,通过田间小区试验,筛选出低毒、低残留、安全、高效的防治谷
最近几年,采用红至红外波长(600~1100 nm)的低功率光照(low-dose light,LDL)疗法对组织代谢系统、神经系统、血液循环系统和免疫系统等方面的调节效应已经引起了广泛关注.同
通过对《黄帝内经》有关营卫理论的研究,从营卫与精神的关系、《黄帝内经》营卫失常所致疾病等方面对营卫理论在疾病发生发展过程中的重要作用进行了阐述。
小肠结肠炎耶尔森氏菌(Yersinia enterocolitica)是二十世纪八十年代开始引起广泛关注的人畜共患肠道病原菌,也是感染性腹泻中常见的食源性病原菌。小肠结肠炎耶尔森氏菌广泛存
编者按$$ 加大知识产权执法力度,是保障知识产权制度健康有序运行的需要,也是完善社会主义市场经济体制、推动经济发展方式加快转变的需要。保护知识产权既要靠司法机关依法
报纸
<正> 这里指的内蒙古、显然不是全自治区的面貌和状况,不是地理所提供的一切特征、而是历史遗留下的一个为人们深记在脑海里的民族特征的代表印象—一辽阔的草原、从事畜牧业
随着在用车数量的不断攀升,城市大气污染日益加剧,在用车污染物排放量占很大比例,柴油车对大气PM2.5的贡献超过20%,国家相关部门制定了一系列环保法规,先后出台新车和在用车