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本文在对企业进行问卷调查和实地调研的基础上，运用理论研究和实证分析并重、定性分析和定量分析相结合的方法，对闽台高技术产业互补问题进行了深入探讨。一方面，把闽台高技术产业看成一个复杂的互补系统，对系统的要素、结构、功能、性质进行了理论研究；另一方面，通过实证分析，探讨闽台高技术产业互补合作的必要性，揭示产业发展具有的互补性，并对互补现状与存在问题进行了研究分析。指出闽台高技术产业要充分发挥互补性，深入、高效地开展互补活动，关键在于建立一套有效的互补机制，包括动力机制、区域协调机制、要素整合机制、产业关联机制、约束和保障机制等，最后提出了相应的对策与建议。