禽流感全球肆虐，给人类经济和健康带来巨大威胁。野鸟作为禽流感病毒(Avian influenza virus，AIV)的“活动载体”，通过季节迁徙将病毒传播至不同地区，加速了病毒基因融合与重组病毒的产生。基于此，本论文对我国东部省份采集的野鸟样品禽流感病毒进行调查和分析，探究野鸟迁徙和禽流感病毒演化、循环及分布之间的规律，为病毒溯源及高致病性禽流感病毒(Highly pathogenicavian influenza virus，HPAIV)的防控预警及野鸟禽流感监测方案的制定提供科学依据和数据支持。　　本研究检测并分析了，2013年9月至2014年11月我国东部四省市:北京、上海、江西和浙江采集的2449份样品中的禽流感病毒。监测数据显示，禽流感病毒在我国仍然普遍存在，样品病毒检出率高达29.0％(2449)，南方城市检出率高于北方城市，咽、肛拭子检出率高于粪便。雁形目、鹳形目和具有迁徙习性的雀形目鸟类也可以携带病毒迁移，它们迁徙途经地多数留鸟病毒感染率高达40％以上。不同种类鸟类咽、肛排毒比例不同。雁形目驯化鸟类相对野生鸟类感染率高。因此，采样应以拭子样品为主、粪便样品为辅，并重视多种鸟类种类的采集。通过与往年检测数据比对，禽流感病毒的检出率逐年升高，推测2015年高致病性禽流感病毒发生风险较高，应进一步加强对野鸟禽流感病毒的监测。从220份检测阳性样品中，鸡胚分离得到12株病毒，其中包含了最近国内流行的H5N8、H5N2和H7N9病毒，以及相对少见的H6N1病毒。　　对监测分离的低致病性禽流感病毒(Lowly pathogenic avian influenzavirus，LPAIV) H6N1进行同源进化分析和位点分析，发现该H6N1病毒由不同亚型病毒重组产生，其基因分别来源于位于东亚-澳大利亚与西亚-东非野鸟迁徙通路多个国家，证实野鸟可以通过迁徙将不同地域病毒带入我国，进而融合产生新型病毒。该病毒虽然特异性亲和禽类α-2，3-唾液酸受体，但可以成功在小鼠肺脏中复制，引起小鼠间质性肺炎。该病毒由自然基因库病毒重组而来，其还可以作为病毒演化中基因库贮备病毒，存在将其致病基因片段传播给其他禽流感病毒、甚至高致病性禽流感病毒的可能性。　　从监测的阳性样品里，分离出高致病性禽流感病毒H5N8。通过序列比对和同源进化分析，该病毒属于2.3.4.6支系，该支系病毒2013年底已在我国东部上海、浙江、江苏等多个省市的野鸟群体或活禽市场存在。同时，这些病毒与2014年韩国疫情毒株序列相似，都可以追溯到由我国2010年江苏毒株演化产生，因而可以推测，野鸟可能通过东亚-澳大利亚通路迁徙，将病毒传播至不同地域。　　本研究通过对我国东部野鸟禽流感病毒主动监测，发现了我国野生鸟类中禽流感病毒的感染状况与分布规律，证实了鸟类迁徙可以将病毒基因传播至不同地点，通过对分离毒株进一步分析，了解到低致病性禽流感病毒的演化动态与高致病性禽流感病毒的分布状态，为禽流感病毒的溯源、高致病性禽流感病毒发生风险的评估及野鸟禽流感监测方案的制定提供科学依据。