三角帆蚌肽聚糖识别蛋白S和L基因cDNA全长克隆及组织表达分析

来源 :江西师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fanfrong
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模式识别受体(Pattern recognition receptors,PRRs)是识别微生物表面病原体相关分子模式(Pathogen-associated molecular patterns,PAMPs)的一类先天免疫分子,肽聚糖识别蛋白(Peptidoglycan recognition proteins,PGRPs)家族是PRRs一员可识别细菌肽聚糖(Peptidoglycan,PGN)。PGRPs在无脊椎动物和脊椎动物中高度保守,如软体动物。本研究采用5′、3′RACE技术,对高通量转录组测序所得三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)PGRP-S(hcPGRP-S)和PGRP-L(hcPGRP-L)基因部分片段分别进行了5′、3′末端克隆,经拼接得到hcPGRP-S和hcPGRP-L cDNA序列全长,并采用实时荧光相对定量(qRT-PCR)技术检测了其组织表达分布,及经肽聚糖和脂多糖(Lipopolysaccharide, LPS)刺激后在肝胰腺中的表达变化。  hcPGRP-S基因cDNA全长1438 bp,开放阅读框长858 bp,编码285氨基酸(aa),预测分子量大小为32.3 ku,理论等点为7.98,无信号肽和跨膜结构。与其他物种PGRPs氨基酸序列多重比对发现,hcPGRP-S氨基酸序列与夏威夷短尾鱿鱼PGRP4同源性最高(51%),而与牛PGLYRP3同源性最低(33%)。qRT-PCR检测结果表明,hcPGRP-S在性腺、肝胰腺、鳃、心脏及外套膜均有表达,性腺中表达水平最高。经PGN或LPS注射刺激后,肝胰腺中hcPGRP-S表达水平显著上调,表明hcPGRP-S可能在三角帆蚌的肝胰腺抗菌免疫反应中发挥重要作用。  hcPGRP-L基因cDNA序列全长1716 bp,开放阅读框长1263 bp,编码420 aa,预测蛋白分子量大小为48.24 ku,理论等电点为8.58,预测有4个潜在N-糖基化位点,分别为N67QT、N99KS、N193LT和N229SS,有PGRP结构域(aa249-391),hcPGRP-L无信号肽和跨膜螺旋结构。氨基酸序列多重比对发现,hcPGRP-L氨基酸序列与三角帆蚌PGRP-1a、PGRP-S、PGRP-S1和PGRP-S2同一性分别为57%、62%、53%和56%。hcPGRP-L在性腺、肝胰腺、鳃、心脏及外套膜均有表达,而在性腺中表达最高。经PGN注射刺激后,肝胰腺中hcPGRP-L表达水平显著上调,而LPS刺激后hcPGRP-L表达水平无显著变化。
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