核酸是构成生命体极为重要的生命物质，包括脱氧核糖核酸（DNA）和核糖核酸（RNA）两大类。核酸作为生物体基本的遗传物质，在蛋白质的复制和合成中起着储存和传递遗传信息的作用。蛋白质与核酸的相互作用是许多生命活动的重要组成部分，目前也是分子生物学的研究热点之一。化学修饰的寡核苷酸可用于基因分析，蛋白质结构及其活性的研究。目前，在研究蛋白及其与核酸的相互作用方面的研究，化学修饰的寡核苷酸已成为一种重要的研究手段。商业化合成寡聚核苷酸一般采用固相合成的方法，而亚磷酰胺法固相合成法是一种最为常用的方法。核苷酸是多官能团的化合物，需将暂不需要的且易于发生反应的基团先保护起来，即先采用化学修饰核苷分子的方法得到亚磷酰胺单体，再根据需要进行脱保护，最后通过固相合成得到设计序列的核苷酸以用于结构生物学方面的研究。而用于固相合成的亚磷酰胺单体在常温下稳定性较差，在市场上较难获得，如需其用于研究，一般是实验室自行合成。本文通过4,4’-二甲氧基三苯基氯甲烷，2-氰基乙基二异丙基氯代亚磷酰胺以及异丙氧基硅氯甲烷等羟基保护剂分别对碱基不同位点上的羟基进行保护，设计合成了5种固相合成前体：TM₁，TM₂，TM₃，TM₄和TM₅。论文在第三章重点对溶剂及温度进行了探索，成功合成了目标化合物TM₁，并利用其得到的寡聚核苷酸通过化学交联法对胞嘧啶脱氨基化机制进行了研究；第四章成功合成了目标化合物TM₂，为DNA甲基化剪切机制的研究提供了关键的前体；第五章合成了RNA中尿苷、胞苷及腺苷相对应的亚磷酰胺单体TM₃，TM₄和TM₅，为RNA的固相合成提供了前体，同时也为其工业化生产奠定了基础。