基于基因表达芯片技术的镍离子细胞毒性机理研究

来源 :东南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ZYXN
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
金属生物医学材料镍钛合金,由于具有良好的力学、物理、化学性能,以及形状记忆的智能特性,在人体矫形、介入性治疗、牙科、面部治疗等医学领域得到了广泛的应用。但是,镍钛合金中约含有56wt%的镍元素,其在体内释出的镍离子对生物体潜在的危险没有排除。为了使镍钛合金材料在生物体内的使用更加安全可靠,需要对镍离子的生物相容性进行长期深入的研究。 本论文的研究目的之一是在细胞毒性实验的基础上,采用基因表达芯片技术和生物信息学以及RT-PCR验证的研究方法,从基因组水平上探索Ni<2+>离子对细胞的分子毒性机理,评价其分子生物相容性。研究目的之二是探索研究生物材料与机体相互作用的机理的新途径,为建立基于基因表达芯片技术的生物材料相容性评价的新方法打下基础。 本论文的研究内容如下: 1.采用MTT法评价了100、200、300μM的镍离子(Ni<2+>)溶液处理小鼠结缔组织成纤维细胞L929细胞12h、24h、36h、48h、60h、72h后的细胞毒性。实验结果表明,Ni<2+>离子在100μM的浓度下对L929细胞的毒性较低,仅在处理时间达到72h时毒性级别达到1级;200μM Ni<2+>离子在处理12h~36h时毒性影响较小,为0级毒性,处理48h~72h时毒性影响增加,为1级毒性;300μMNi<2+>离子毒性较前两个浓度有明显的增强,处理24h时毒性级别即达到1级,处理时间48h以上时毒性均为2级。总体来说,细胞毒性随着镍离子处理浓度的增加而增强,随着镍离子处理时间的增加而增强,具有浓度.时间的依赖性。 2.采用流式细胞仪检测了100、200μM Ni<2+>处理L929细胞24h、48h、72h后对细胞周期的影响。实验结果表明,Ni<2+>作用24h时,两个浓度组G<,0>/G<,1>期细胞所占的比例较阴性对照组有所下降,S期和G<,2>/M期细胞所占的比例有所上升,其中S期细胞比例上升更为明显,说明此时Ni<2+>有促进细胞周期由G<,0>/G<,1>期向S期转移的作用。但是随着镍离子作用浓度的增加,这种转移能力减弱。而当Ni<2+>作用时间达到48h和72h的时候,两个浓度组G<,0>/G<,1>期细胞所占的比例增加,S期和G<,2>/M期细胞所占的比例则相应减少,说明在这两个时间点上Ni<2+>可能诱导了L-929细胞停留在G<,0>/G<,1>期,减少了S期细胞,从而使细胞增殖减慢。 3.根据MTT实验结果,选用100μM浓度的Ni<2+>离子溶液分别处理L929细胞不同的时间(12h、24h、48h和72h),以及200μM浓度的Ni<2+>离子溶液处理L929细胞12h后,提取其细胞总RNA,同时提取了正常细胞的总RNA作为对照,并经质检合格,以用于基因表达芯片实验。 4.采用BioStarM-140s芯片(含14112个基因),分别以100μM浓度的Ni<2+>离子溶液处理L929细胞12h、24h、48h和72h,200μM浓度的Ni<2+>离子溶液处理L929细胞12h后的细胞总RNA作为实验组(共5个实验组),以正常细胞总RNA为对照组进行了基因表达芯片实验。每个实验组采用两张同型号的芯片在同样的实验条件下进行重复。实验结果表明,在上述5个实验组中发生差异表达的基因数分别为:708个、121个、97个、463个和452个,其中有效的差异表达基因数则分别为:635个、106个、85个、415个和403个。 5.在基因表达值Ratio分析以及基因功能分析的基础上,筛选出了11个基因对其表达水平进行荧光定量RT-PCR的验证。验证结果显示,有8个基因的表达情况与芯片结果完全一致。说明通过荧光定量RT-PCR实验技术,大部分基因的表达可以获得验证。 6.采用Cluster& TreeView对5个实验组的差异表达基因(共1201个基因)进行层次聚类分析,发现:100μM Ni<2+>处理24h实验组与100μM Ni<2+>处理48h实验组的基因表达差异情况最为相似,其余三个实验组的差异表达情况则各有差异。100μM Ni<2+>处理12h、24h、48h和72h后的基因表达时间模式分析显示,上调组中基因表达模式共有14种,下调组中基因表达模式共有11种。两者在表达模式的分布上存在着一定的差异,并且,在同一表达模式中的基因富集程度也存在不一致性。 7.利用基于GO(Gene Ontology)基因功能分类体系的GoSurfer、FatiGO+软件,通过差异表达基因的富集程度来寻找实验条件相关的基因功能类。分析结果显示,差异表达基因较为富集的几个功能类有代谢、定位、细胞通讯、生物学过程的调节、蛋白质结合、离子结合、核酸结合、水解酶活性、核苷酸结合、转移酶活性等。 8.采用GenMAPP(Gene MicroArray:Pathway Profiler)软件对5个实验组中的差异表达基因参与的路径进行了分析,发现在Local MAPPs包含的79个路径中,有差异基因表达的路径共57个。其中,包含差异表达基因数大于14个的路径共有6个,分别为:粘着斑、胰岛素信号、mRNA处理的结合过程、电子传递链、核糖体蛋白质、平滑肌收缩。对这6个路径进行差异表达基因详细信息及相关文献的查询,综合分析后,对Ni<2+>离子分子水平上的毒性机理进行了初步分析。
其他文献
老年人免疫力相对较弱,属于易感人群.养老服务机构人员密集,防控工作难度高、责任大.沈阳市民政局迅速行动、主动作为,努力打造全市养老服务机构疫情防控“安全岛”.一是实施
期刊
本文通过对NND格式的分析和对比,选择了空间高分辨率的三阶NND(无波动、无自由参数、无耗散)格式,建立了孤立转子内三维N-S方程的高分辨率和高效率的数值分析程序。用该程序分别计算了NASA-37跨音速转子和NWPU-1亚音速转子,计算结果表明本文建立的孤立转子程序能够较好的模拟轴流压气机叶片排内流动情况,能够有效的捕捉通道激波和间隙泄漏涡轨迹以及叶片附面层的分离。数值分析结果与实验吻合较好,从而
海口市民政部门严格按照省政府重大突发公共卫生事件Ⅰ级响应机制要求,采取了最严格的防控措施,对全市养老机构实行封闭管理,全力以赴保障老人们的身体健康、生命安全,筑牢养
期刊
信阳市民政局高度重视养老服务机构疫情防控工作,印发了《关于进一步做好我市养老服务机构疫情防控工作的通知》,三措并举,全力升级2.0版养老服务机构疫情防控安全网.一是进
期刊
超稠油采出液中悬浮物、胶质、沥青质等含量高,细小砂粒的“空间位阻”效应显著,采出液的深度脱水处理难度较大。高压脉冲电场能够显著提高破乳效果,但是该项技术尚未应用于超稠
本文通过对荣华二采区10
期刊
人们一般以某一火灾场景是否会发生轰燃来判断火灾的危险性,因为轰燃标志着火灾进入了充分发展阶段.轰燃发生的量化判据是火灾数值模拟判断轰燃发生的标准,区域模拟和场模拟
广安市民政系统坚决落实省市疫情防控要求,科学防控、及时应对、群防群控,念好“七字诀”,打好打赢养老机构防疫阻击战.一是念好“责”字,确保责任到人.坚持把全市养老机构疫
期刊
佛山市民政局对民政系统重点防控的养老服务领域高度重视、周密部署,及时督促指导各区民政部门、各养老服务机构严格落实各项防控措施,确保服务对象安全,做到守土有责、守土
期刊
随着我国电力工业科技进步和电力体制改革的深化,发电企业对汽轮发电机组状态监测和故障诊断技术提出了新的要求:现行的设备检修体制已阻碍了电力生产企业效益的进一步提高,