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中国是梨的起源中心和主要的多样性中心之一,且梨属植物被认为是第三世纪起源于中国西部和西南山区。梨树在中国已有3000多年的栽培历史,在中国主要水果中其栽培面积和总产量均排第三。根据梨种质资源的原生地理分布,可划分为东方梨和西方梨两种。中国作为东方梨主要原产地之一,具有丰富的种质资源,且现已经定名的梨属植物有13个种。面对如此多的梨种质资源,进行种质鉴定和亲缘关系及种群结构分析,不仅对梨种质繁育具有重要的意义,也是保护这些种质知识产权的需要。SSR标记具有数量多、多态性丰富、共显性遗传、特异性强、出现频率高、重复性好和操作简便等优点,有利于构建分子身份证、亲缘关系分析和种群结构分析等的研究。本试验选取294份梨种质材料,包括137份白梨、57份秋子梨、25份砂梨、19份新疆梨、43份杂交品种、1份川梨、3份杜梨、1份河北梨、2份褐梨、4份木梨和2份西洋梨,利用SSR分子标记技术进行亲缘关系及种群结构分析,并构建种质分子身份证。主要试验结果如下:1、利用17对荧光标记SSR引物对294份梨种质进行扩增,获得400个等位基因,每个位点扩增的等位基因数从15-35个不等,平均为23.5个,片段长度63-364bp;位点期望杂合度在0.710-0.904,表观杂合度为0.418-0.833,香农信息指数为1.697-2.707。引物可区分供试梨种质的数量从42份到103份不等,平均每对引物可区分种质数量为72份,区分率为14.3%-35.0%,平均区分率为25.6%。2、构建了294份梨种质的分子身份证和条形码标识。聚类分析在相似系数0.871处,294份梨种质聚为四个组,与地理位置相关,除了‘绥中谢花甜’和‘粉红宵’,均能将其他种质材料区分开,其中‘南果梨’的芽变品种‘南果4号’和‘大南果’,‘尖把’与其芽变品种‘尖把王’,及‘秋子’与其芽变品种‘甜秋子’也均被区分开。SSR标记可以区分梨的芽变品种,可用于梨种质的鉴别和保护。3、中国西部地区的梨种质亲缘关系较近,梨种质的亲缘关系与地理位置相关。白梨的遗传背景明显区别于别的种群,分为两种类型,即华北平原地区的白梨和燕山山脉附近的白梨。新疆梨的遗传关系与西部地区的梨种质亲缘关系较近。野生秋子梨与栽培秋子梨具有不同的遗传背景,亲缘关系较远。4、‘库尔勒香梨’是具有燕山山脉附近白梨、野生秋子梨和栽培秋子梨基因渗透的新疆梨品种,‘铁皮’、‘红密’和‘费县红梨’应归类为白梨,白梨也具有褐皮的品种。‘苹果梨’是具有白梨基因渗透和秋子梨基因渗透的品种,‘野梨1’和‘野梨2’应该归类为白梨。