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丙型肝炎病毒（Hepatitis C virus,HCV）是导致慢性肝脏疾病的主要致病因素之一,具有很高的流行率。据世界卫生组织统计,全世界约有1.8亿人染HCV。一旦感染即呈现高度慢性化致病过程,80%的急性感染者可发展为慢性丙型肝炎,慢性感染患者无明显临床症状,部分慢性肝炎患者最终发展为肝硬化乃至肝细胞癌。目前为止,HCV的感染和致病机理尚未完全明确,但是免疫性肝细胞损伤,病毒产物引发的细胞毒性,增强的氧化性应激等因素可能是HCV感染导致肝损伤的潜在机制。丙型肝炎的进展、严重程度、治疗反应性差异与宿主因素相关,如年龄、性别、线粒体DNA（Mitochondrial DNA,mtDNA）拷贝数、宿主基因IL28B、IP-10、ITPA、PNPLA3的多态性。本研究主要针对HCV的感染与部分遗传因素（mtDNA和IFN-λ）关系以及临床症状受宿主遗传因素的影响开展研究。首先提取参与者样本的外周血细胞基因组DNA,利用实时荧光定量PCR（Fluorescence-based quantitative real-time PCR,FQ-PCR）方法检测病例（N=242）-对照（N=226）中每个样本外周血细胞中mtDNA拷贝数。此外,在261名未接受任何治疗的患者和265名健康人构成的对照组中选择可以覆盖整个IFNλs基因区域（IL28A,IL28B和IL29）的10个单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphisms,SNP）位点rs8099917,rs10853728,rs11883177,rs12980602,rs4803224,rs11671087,rs11665818,rs8108008,rs7248931 和 rs30461 基因分型进行研究。本次研究结果发现,HCV感染导致患者外周血细胞mtDNA拷贝数减少（68.80±51.80 Vs 81.53±67.70,P=0.023）。我们将患者和对照区分性别进行比较:结果发现男性HCV患者（N=63）的mtDNA拷贝数（62.06±49.50）比对照组（N=64,98.42±74.16）显著降低（P=0.002）;而女性感染者（N=179,71.17±52.51）和对照组（N=162,74.86±64.00）之间无差异（P=0.559）。随后,我们分析了 HCV感染者的主要血液生化指标与mtDNA拷贝数是否存在相关性,发现高密度脂蛋白（High-density lipoprotein cholesterol,HDL-C）与 mtDNA 拷贝数变化负相关（r=-0.128,P=0.047）,并且这种相关性在男性患者中更显著（r=-0.4,P=0.001）。虽然谷草转氨酶（Aspartate amino-transferase,AST）和 mtDNA拷贝数间无相关性（r=-0.006,P=0.924）,但是在男性患者中两者正相关（r=0.255,P=0.043）。IFNλ基因的10个SNP位点的等位基因和基因型频率在病例-对照组间并无差异,但在两组间进行了单倍型频率分析发现,由10个SNP位点构建的单倍型中,大多数的单倍型在两组间无统计学差异,而相比于对照组（1/530=0.2%）,单倍型（TGTGTGTG）在病例组中（11/522=2.1%）具有更高的频率（P=0.003;OR=11.387,95%CI=1.465-88.524）。随后,我们分析了样本SNP基因型与血液生化指标关系后发现:rs8099917 TT 型,rs10853728 CC 型,rs11883177 AA 型,rs12980602 CT 型,rs48032224 CG 型提高 HCV 患者 ALT/AST 比值;rs10853728 CC基因型患者的总胆红素升高。综上所述,我们的研究证实了 HCV患者外周血细胞中可以检测到mtDNA拷贝数的变化,并且这种变化受性别因素的影响,男性患者mtDNA拷贝数降低并且与某些血液生化指标相关;IFNλ基因的变异影响HCV的感染并且与患者的血液生化指标相关。本论文的研究成果对云南地区HCV的预防、诊断和治疗具有重要意义。