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星状病毒是小的无囊膜的单股线状 RNA病毒,1975年首次通过电镜从英格兰产科病房胃肠炎的婴儿中观察到该病毒。随后,在陆生的哺乳类和禽类及水生动物中都检测到星状病毒。目前,不断发现动物和人类的新型星状病毒。星状病毒的多型性和重组可能造成宿主间的交叉感染,和与其他病毒的或者非病毒的病原混合感染,星状病毒通过不断适应经典的和新的宿主,可能导致人畜共患的星状病毒发生的风险。此外,已经有报道人和不同动物的星状病毒能引起神经症状。 本研究主要针对早期发现的30年来未受重视的牛星状病毒。(1)首先对广西奶牛和水牛的牛星状病毒进行流行病学调查。从5个规模化牛场(3个奶牛场和2个水牛场)收集0-6月龄有腹泻症状小牛的直肠拭子共211份。用 RT-PCR检测结果显示,牛星状病毒的阳性率43.6％(92/211),其中奶牛阳性率46.10%(71/154),水牛阳性率36.84%(21/57),说明牛星状病毒在广西奶牛和水牛场普遍存在。(2)为了了解牛星状病毒与其它常见牛肠道病毒如BEV,BVDV,BCoV,BRV,BToV等的混合感染情况,从211份的直肠拭子取32份进行这些病原的检测。结果发现牛星状病毒和以上肠道病毒其中一个或者多个病毒混合感染,混合感染率比例高达87.5%,其中只检测到牛星状病毒4份,检出率为12.5%(4/32)。(3)目前星状病毒基因型MAstV33包括 BAstV B18/HK,BAstV B76-2/HK,CcAstV-1/DNK/2010和CcAstV-2/DNK/2010,克隆星状病毒的部分和全长 ORF2,氨基酸进化分析结果表明牛和水牛的星状病毒分成5个群(3个牛的,2个水牛的),均属于哺乳动物星状病毒属,均分布于基因型 MAstV33,表明水牛也是星状病毒基因型 MAstV33的宿主。(4)本研究获得了两条接近全长的星状病毒的基因序列（BAstV-GX7/CHN/2014和BAstV-GX27/CHN/2014)个为6233bp,两者核苷酸同源性为96.7%。与 NCBI上登陆的全长牛星状病毒序列相比较,核苷酸同源性为67.6%-87.3%,而且都与 BAstV B76-2/HK(2011年的香港牛星状病毒)同源性最高。另外,全长基因分析结果表明,广西牛星状病毒与能引起牛神经症状的BAstV NeuroS1/USA同源性很低(46%-48.6%),从基因分型来看,广西牛星状病毒可能不会引起牛神经性症状。此外,获得的两个近全长基因组进行分析发现它们包括了星状病毒特有的3个编码区（ORFs)和2个非编码区（UTRs)。ORF1a长2397bp,编码798aa的非结构蛋白（nsp1a)。且使用TMHMM Server v.2.0和NCOILLS version1.0等软件预测了nsp1a的5个跨膜螺旋结构和2个28aa卷典螺旋结构,表明该获得的nsp1a完整。ORF1b长1579bp,其中编码区长1509bp,编码502aa,包括RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp)。ORF2长2316bp,编码771aa的病毒衣壳蛋白(结构蛋白)。ORF1a/ORF1b重叠区含有116核苷酸,核糖体移码信号(A6C)位于靠近ORF1a的3′末端(2387-2393nt)。ORF1b/ORF2重叠区含有高度保守56个核苷酸。上游ORF2起始密码子中的保守序列是预测牛星状病毒的次基因组合成的启动子的信号。 总之,本研究对广西牛星状病毒进行了分子流行病学调查,首次从腹泻的水牛中检测到牛星状病毒,并且进行基因分析,获得了25个部分序列和2个接近全长基因组牛星状病毒序列,把序列提交到 NCBI数据库。本研究不但丰富了星状病毒的基因库,对星状病毒分子研究提供了依据,同时在临床上对该病的控制也有重要的意义。