牛骨形态发生蛋白受体IB基因(BMPR-IB)cDNA的克隆及序列分析

来源 :上海水产大学 上海海洋大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liang630223
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本研究从影响牛的繁殖性能的BMPR-IB基因出发,利用Genbank中其它物种的序列信息,通过序列比对、分析和RT-PCR方法,对尚未报道的牛BMPR-IB基因序列进行扩增、克隆测序、及序列分析。方法:1、在Genbank中查找人、小鼠和羊的BMPR-IB基因序列,运用DNAStar软件对这些序列进行同源性分析。依据同源性较高区域设计引物。首先提取牛卵巢组织中的总RNA,采用RT-PCR技术扩增牛BMPR-IB的部分cDNA序列,将此片段重组到PMD18-T载体中,双酶切和PCR鉴定后测序,获得长为953bp的牛BMPR-IB部分cDNA序列,克隆片段编码297个氨基酸。2、克隆后序列与Genbank公布其它物种包括绵羊、山羊、人、猴子、黑猩猩、家鼠、挪威鼠、猪、袋鼠、狗和鸡的核苷酸序列同源比对,发现它们的同源性分别为98%、97.6%、91.9%、91.7%、92.1%、87.9%、87.3%、92.9%、86.8%、91.6%、83.9%,证实克隆的序列为牛BMPR-IB序列,为克隆其它BMP家族成员提供了依据。3、进行了氨基酸序列基本性质进行了分析,并发现牛的氨基酸序列与上述11种动物的氨基酸同源性都在98%以上,并且进一步对蛋白质二级结构进行了预测,为我们更好的理解牛的生殖机理提供帮助。此序列已登陆Genbank,登陆号:DQ489533。
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