鲍曼不动杆菌裂解性噬菌体XW-59的分离鉴定和全基因组序列分析

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鲍曼不动杆菌(Acinetobacter baumannii)是专性需氧的、非发酵的革兰阴性杆菌,广泛分布于自然界中,属于条件致病菌。临床资料显示,在感染标本中鲍曼不动杆菌的检出率不断上升,现普遍认为鲍曼不动杆菌是引起医院内感染的重要病原菌之一。另一方面,鲍曼不动杆菌多重耐药菌株和泛耐药菌株的出现造成抗生素疗效的下降。因此,鲍曼不动杆菌严重威胁着免疫功能缺陷的住院病人(如接受放疗和化疗的肿瘤患者、接受器官移植的病人、大面积烧伤患者和患有各种慢性疾病的老年人)。鲍曼不动杆菌引起的感染和日趋严重的耐药性已成为人们关注的公共卫生问题。近十几年来有关利用噬菌体用于耐药性细菌感染又引起人们的兴趣。本研究目的是通过研究鲍曼不动杆菌裂解性噬菌体的生物学特性,为噬菌体疗法应用于细菌性感染提供依据。采用双层琼脂法以鲍曼不动杆菌为宿主菌从环境污水中分离到一株裂解性噬菌体,命名为XW-59。通过电镜观察,噬菌体XW-59的形态学特征符合有尾噬菌体目(Caudovirales Order)、短尾病毒科(Podoviridae Family)噬菌体。噬菌体XW-59的最佳感染复数为10。一步生长曲线显示,噬菌体XW-59的潜伏期为10 min,爆发期为30 min。稳定性试验表明,噬菌体XW-59在60℃1h的条件下和在pH4~10的范围仍保持其裂解活性。将提取并纯化的噬菌体XW-59的基因组提交至联川生物技术有限公司(杭州,中国)进行基因测序,测序平台为IlluminaHiSeq PE150。结果表明,噬菌体XW-59基因组为双链DNA、由40,958bp组成,G+C含量为39.42%,未发现tRNA。利用GeneMarks软件并结合RAST软件对基因组进行注释。结果发现,噬菌体XW-59基因组含有50个编码序列(Coding sequences,CDSs),其中13个编码序列可预测其功能,37个编码序列为未知基因。通过BLASTn在线软件比对,噬菌体XW-59基因序列与鲍曼不动杆菌噬菌体vB_baM_IME200具有很高的同源性。综上所述,噬菌体XW-59对鲍曼不动杆菌具有较好的裂解活性,而基因组序列分析将有助于今后深入研究噬菌体在鲍曼不动杆菌感染中的应用。
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