本研究旨在通过利用同位素标记相对和绝对定量（iTRAQ）技术联合纳升液相色谱和串联质谱（NanoLC-MS/MS）技术，研究一对不同转移潜能的高低转移肺癌细胞系SPC-A-1sci和SPC-A-1的差异表达蛋白，以筛选出非小细胞肺癌（NSCLC）转移相关的标志物或治疗靶点。　　第一部分：NSCLC转移相关差异膜蛋白的定量分析。共鉴定出差异表达蛋白59个，上调27个，下调32个。对获得的差异蛋白进行基因显著性（GO）分析。应用实时定量 PCR（qTR-PCR）和蛋白质印迹法（WB）验证差异膜蛋白，结果与质谱定量一致。　　第二部分： NSCLC转移相关差异总蛋白的定量分析。共鉴定出蛋白5818个，定量蛋白5443个，标记率达到93％，上调131个，下调125个。对这些差异蛋白进行GO和Pathway分析，并对21个差异蛋白进行qTR-PCR和对10个差异蛋白进行WB验证，结果与质谱定量一致。结果提示MYH9，GSN，ANXA4和CPNE3是4个新的可能与NSCLC转移相关的蛋白。　　第三部分：NSCLC转移相关蛋白CPNE3的功能及初步机理研究。通过si-RNA分析这4个候选蛋白的功能。结果提示MYH9和CPNE3可能促进细胞的迁移和侵袭。CPNE3的体内实验提示降低 CPNE3的表达能抑制非小细胞肺癌的转移率和结节的形成。免疫组化的实验结果也证明 CPNE3的表达与NSCLC病人的临床分期和TNM分期密切相关。本实验在体外和体内水平揭示CPNE3可能是NSCLC治疗的一个新的干预靶点或预后指标。