公共基础设施和R&D对我国的经济和社会发展起到重要的支持作用,基础设施是国家和地区经济发展的必要前提,而R&D则是经济增长的重要驱动力。同时,基础设施与R&D投入是制造业发展和升级的基础。当代中国,制造业的发展很大程度上得益于政府的基础设施投资,而R&D投入是提升制造业能级的关键。因此,在当前我国为应对金融危机对制造业产业进行调整的情况下,研究公共基础设施和R&D与制造业生产率之间的关系,进而为我国制造业的加快发展提供思路变得十分重要而迫切。本文根据中国按两位数行业分类标准的20个制造业行业1996—2009年的面板数据,运用计量经济学模型,分析了公共基础设施与R&D对中国制造业产业的成本结构和生产率的影响。研究发现：公共基础设施投入的增加可以降低大部分制造业行业的平均生产成本,公共R&D投入的增加也可以降低部分制造业行业的平均生产成本,公共基础设施和R&D对不同行业的劳动力、资本和中间品投入要素需求弹性存在正负差异,并且公共R&D对制造业中的高技术行业和非高技术行业的生产率均有显著的正的影响。