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随着人类基因组测序计划(human genome sequence project)的完成及蛋白质组学相关技术的迅速发展。产生了蛋白质组学(proteomics)—研究细胞内全部蛋白质的组成及动态变化的一门新兴学科。蛋白质组学可以分为两类型,第一类是表达蛋白质组学,是研究不同样本间蛋白质表达量变化。第二类是功能蛋白质组学,是通过分离蛋白质复合物、系统研究蛋白质间相互作用,从而建立细胞内信号转导通路的网络图。蛋白质组学的核心技术包括二维电泳、质谱分析、蛋白质组信息学。蛋白质组学部分承用了创立于二十多年前的二维电泳(two-dimensional gel electrop-horesis 2-DE))技术,基于其高分辩能力,二维电泳主要用于分离和检测复杂混合物中的蛋白质。虽然没有获得更多的改进,但是二维电泳结合质谱测定蛋白质的最新进展,已成为蛋白质组学中的一项重要技术。肿瘤细胞或组织蛋白质样本通常经过二维电泳等技术可以按分子量大小、等电点或类型得以分离,然后通过质谱技术和蛋白质数据库比较,进一步将特殊的感兴趣的蛋白质鉴定出来。通过引进差异凝胶电泳(differential in-gel electrophoresis, DIGE)使二维电泳得到改进。差异凝胶电泳是使用不同的荧光染料分别对来自两个样品的蛋白质进行标记,将标记了的两个样品混合后进行2-DE。由于两种荧光染料的发光波长不同,从而使同一块胶上两个样品的蛋白质分离并能准确测出其含量差异。同位素亲和标签(isotope coded-affinity tags, ICAT)是另外一种蛋白质分离技术,