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在进行数据库结构设计时，对变长记录的处理是一个难点，而建立一个以查询为主的数据库考虑到查询效率，在建库时又要做许多特殊考虑。本文针对中草药名鉴数据记录的变长特点，采用建立关键词库的方法建立了中草药名鉴数据库，并采用词法分析的方法，实现了数据的自动提取，并实现了数据的高效查询。最后，还将模糊聚类方法引入到中草药分类中，应用模糊聚类分类方法，对全国中草药名鉴数据库名鉴系统中草药检索信息进行模糊聚类，为中草药的开发和研制提供一些科学依据。