论文部分内容阅读
环肽因其在序列和成环方式上的多样性,显示出丰富的结构多样性与功能多样性,在生化研究中扮演越来越重要的角色,如自组装形成纳米管结构、与靶点蛋白结合参与代谢调控等。本论文以分子动力学模拟为主要手段,在微观至介观尺度上对特定类型环肽与小分子、磷脂膜和蛋白质等物质之间的相互作用进行了理论研究。具有左/右旋交替残基序列的首尾环肽可形成平环构象,平环间可反平行上下堆叠组装成纳米管结构,纳米管空腔可用于递送货物分子。采用Amber全原子力场对c[-(Aa)5-]自组装环肽纳米管结构进行模拟,结果表明c[-(Aa)